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Small RNA是一大类调控分子,几乎存在于所有的生物体中。Small RNA包括:miRNA,ncRNA,siRNA,snoRNA,piRNA,rasiRNA等。Small RNA通过多种多样的作用途径,包括mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成以及DNA去除,来调控生物体的生长发育和疾病发生。Small RNA高通量测序作为鉴定和定量解析small RNA的新方法和有力工具,实验时首先将18-30 nt范围的Small RNA从总RNA中分离出来,两端分别加上特定接头后体外反转录成cDNA,进一步处理后利用测序仪对DNA片段进行单向末端测序。
一、技术路线和方法:
二、生物信息学分析2.1 基本数据分析Part01:测序质量评估Part02:测序结果分类Part03:microRNA表达量计算Part04:microRNA差异表达分析Part05:差异microRNA靶基因预测Part06:靶基因GO分类Part07:靶基因pathway分析Part08:microRNA与靶基因调控网络构建 2.2 高级数据分析Part09:新microRNA预测Part10:转录因子预测分析Part11:microRNA SNP分析Part12:micrRNA 进化分析
三、二代测序平台
四、完成时间3个月,(其中生物信息分析1个月)
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