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microRNAs(miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70—90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻译,从而在转录后水平调控蛋白表达(最新发现microRNA也能在转录水平调控基因表达)。microRNA在物种进化中相当保守,在动物、植物和真菌等中发现的microRNAs表达均有严格的组织特异性和时序性。microRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用,包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。
一、技术路线和方法:二、生物信息学分析2.1 基本数据分析Part01:原始数据预处理与均一化Part02:差异microRNA筛选Part03:聚类分析(层次聚类、K-means聚类)Part04:差异microRNA靶基因预测(或与mRNA芯片关联分析)Part05:靶基因GO分类Part06:靶基因Pathway分析2.2 高级数据分析Part08:差异microRNA转录因子结合位点分析(或与转录因子芯片关联分析)Part09:差异microRNA与靶基因调控网络Part10:转录因子、microRNA、靶基因互作网络Part11:差异microRNA调解效应评分分析
三、芯片平台
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