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基因组学,是研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。该学科提供基因组信息以及相关数据系统利用,试图解决生物、医学、工业领域、食品与农业等领域的重大问题。全基因组表达谱是指全基因组的转录水平。通过全基因组表达谱研究,加以生物信息学分析,能够解析出在特定条件下(疾病、药物刺激等)整个基因组哪些基因的表达水平上调或下调。生命体是一个复杂的系统,生命活动的调控往往不是单一基因完成的,需要站在宏观(全基因组)层面上研究基因互作。全基因组表达谱芯片能够快速、高通量、特异性地完成全基因组表达谱研究,是全基因组表达谱研究的首选技术手段。
一、技术路线和方法:
二、生物信息学分析2.1 基本数据分析Part01:原始数据预处理与均一化Part02:差异基因筛选Part03:聚类分析(层次聚类、K-means聚类)Part04:差异基因GO分类Part05:差异基因pathway分析Part06:基因互作网络构建(Network)2.2 高级数据分析Part08:转录因子结合位点分析(对植物)Part09:数据驱动网络构建(对多个时间点)Part10:疾病分型Part11:疾病预测模型构建Part12:基因表达趋势显著性分析三、芯片平台
注:其他种类芯片请联系公司销售工程师
四、完成时间2个月,(其中生物信息分析1个月)
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