Nissl染色液染色后呈蓝紫色,常用于显示脑或脊髓的基本神经结构。Nissl小体大而数量多,说明神经细胞合成蛋白质的功能较强;相反在神经细胞受到损伤时,Nissl小体的数量会减少甚至消失。Nissl染色液染色的有效成分是碱性染料焦油紫(Cresyl violet),又名甲酚紫和克紫,它可以和RNA或DNA结合,可以染色粗面型内质网上的核糖体,也可以染色细胞核。染色后使细胞体呈现斑驳的(mottled)蓝紫色染色。也可以用thionine (硫荲);tolridine blue (甲苯胺蓝)等碱性染料。