全基因组连锁分析(博奥晶典)

全基因组连锁分析

　　全基因组连锁分析(Genome-wide linkage analysis)是基于一个或多个家系的样本，通过不同遗传模型，在全基因组水平上来寻找与家族聚集性疾病（或性状）连锁区域的一种分析方法。博奥生物提供的全基因组连锁分析服务主要包括：

1.研究设计相关的咨询服务；

     

2.样品质控：基于SNP分型数据，根据样品的callRate、分型一致率等对样品进行质量控制，检验样本性别及样本间亲缘关系是否正确等；

     

3.位点质控：根据样品的callRate、MAF、孟德尔误差检验结果等剔除不合格的SNP位点；

4.连锁分析：根据疾病遗传模式，选择合适的遗传模型，进行多点参数和非参连锁分析；

     

     

5.modeling LD分析：根据连锁分析结果，对疑似连锁区域modeling LD分析即去除位点间的LD(linkage disequilibrium)重新进行连锁分析；

     

显著位点的注释：用MAS软件对显著位点进行功能注释；

此外，还提供基于候选区域的单点和多点连锁分析服务。

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