CapitalBio miRNA芯片检测
简介
博奥生物miRNA微阵列检测服务针对成熟体miRNA,通过低分子量 RNA分离后直接进行末端荧光素标记,再芯片杂交和结果分析,为客户提供准确、高通量的miRNA分析服务。目前有哺乳动物miRNA 芯片V4.0、植物miRNA芯片V2.0及定制miRNA芯片服务。
检测原理
技术优势
1.通过聚类、SAM等数据分析,可以比较不同组织中miRNA表达的差异情况;
2.芯片miRNA的检测较传统的Northern Blot分析通量高,而且敏感性和特异性均较高;
3.拥有一套先进的芯片实验质控体系,对芯片制作及实验全过程实施严格的质控,保证实验结果的准确、可靠;
4.晶芯 miRNA芯片服务平台是由博奥生物自主研究开发,对整个平台的技术细节及国际进展有很强的把握能力,在提供技术服务的同时还可以给予客户更深层次的建议;目前利用该平台的服务结果撰写的文章已经发表在PNAS,Cancer Research,Oncogene,RNA等专业领域重点杂志上。
应用案例
研究者使用miRNA芯片检测31对原发性食管癌和癌旁组织样品的miRNA表达情况,通过PCA-SVM算法寻找表达模式分类器(包含7个miRNA分 子),从而通过表达数据对癌和癌旁组织进行有效区分。通过Kaplan-Meier生存分析发现hsa-miR-103/107的低表达水平与食管癌病人的生存率高度相关。文献来源: Guo, Y., et al., Cancer Research, 2008, 68(1):1-8
图1.用Cluster3.0软件对31对食管癌/癌旁组织样本进行非监督聚类。C表示癌组织,P表示癌旁正常组织。除6个样本(用“#”标记)被错误分类外,其他所有癌及癌旁正常组织均被正确区分。
图2. Hsa-miR-103/107的表达水平与食管癌病人生存期具有密切关系(A.训练样本集;B.测试样本集)
产品列表
产品编号 | 服务名称 | 产品描述 |
225014 | 晶芯 哺乳动物miRNA微阵列芯片服务V4.0 | 针对人988个(包含预测的122个,Nature,2005,434,338-345)、小鼠 627 个、大鼠 350 个成熟的miRNA,取三者的并集,去除冗余后一共设计了 1320 条探针(数据来自Sanger 的数据库:miRBase 12.0) |
225111 | 晶芯 植物miRNA微阵列芯片服务V2.0 | 将Sanger数据库中2007年2月植物全部的994条序列,去除冗余后得到348个miRNA和朱健康(Zhu Jian- Kang)等上预测的 4个(Cell,2005,123,1279-1291),中科院遗传与发育所预测的74个,芯片上一共有426个miRNA 对应的探针。包括拟南芥、水稻等多个物种。 |
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