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先进的技术,大有用武之地
单细胞测序通过对单个细胞进行基因组扩增和测序,解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向,为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。
科学方案设计
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
信息分析
单细胞测序可针对性揭示单个细胞整体水平的基因信息,解决了细胞异质性难题。可最真实的获得单克隆细胞的具体突变来源及精准的突变频率,用来研究疾病以及癌症发生发展机制等。
去除接头污染序列及低质量数据比对,产出数据统计SNP检测、注释和统计InDel检测、注释和统计CNV检测、注释和统计(仅全基因组测序)SV检测、注释和统计(仅全基因组测序)
1. 数据质控:去除接头污染和低质量数据2. 与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV检测、注释及统计(肿瘤成对样本)
1. 数据质控:去除接头污染和低质量数据2. 与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV检测、注释及统计(肿瘤成对样本)4. 单细胞Germline SNP聚类分析5. PAC(主成分)分析6. Heatmap展示图(somaticSNV)7. 高频突变分析(>2对样本) 7.1高频突变基因统计 7.2高频突变基因富集分析8. NMF突变特征/突变频谱分析 8.1突变频谱分析 8.2NMF突变特征分析(>2对样本)9. NovoDriver已知驱动基因筛选10. 基因组变异Circos图展示
1. 样本间协同性分析(肿瘤单细胞样本数量≥2,且必须有组织样本)2. MRT高频突变基因相关性分析(>2对样本) 2.1高频突变基因协同作用分析 2.2高频突变基因互斥作用分析3. OncodriveCLUST驱动基因预测(>2对样本)4. 突变位点分布情况分析 4.1高频突变基因SNV/InDel突变位点展示 4.2预测驱动基因SNV/InDel突变位点展示5. 高频CNV分析 5.1 CNV分布分析 5.2 CNV重现性分析(>2对样本)6. 杂合性缺失(LOH)分析7. LOF蛋白功能缺失分析8. NovoDrug高频突变基因靶向用药预测9. NovoDR耐药突变筛选10. NovoNoncoding非编码区高频突变分析(单细胞外显子测序仅不包括此分析)
悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力
基因组测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
出色完成每一个项目环节,助力科学研究
采用国际认可的全基因组扩增技术
多次退火环状循环扩增技术(Multiple annealing and looping-based amplification cycles, MALBAC),具有低偏倚性。
定制化信息分析
针对不同项目,除了进行标准信息分析外,通过与合作伙伴共同探讨,制定可行的个性化信息分析方案,整合各种主流软件,优化分析结果,以确保结果的准确性及创新性。
丰富的项目经验
诺禾致源已成功完成单精子全基因组测序、单细胞转录组测序等,相关研究成果在Science、 Nature等顶级科学期刊发表。
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