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良好的兼容性 PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统适用于ABI 377,310,3700,3730,3730xl,3100和3130系统。 操作方便 直接将KB Basecaller分析的trace(扩展名为abi 或ab1的文件)导入PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统,经过短时间处理,系统将自动生成与处理前的trace同名的文件,并存入预先指定的文件夹中(注意:不要将处理结果与KB Basecaller分析的trace存入同一个文件夹)。 更高的读长,更少的错误 PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统从ABI KB Basecaller分析的trace中提取出原始数据,通过一系列zei新算法从头处理,能显著提高测序读长,减少错误,提高通量。 , ABI KB Basecaller 和PeakTrace分析结果的比较 ABI KB Basecaller 和LongTrace分析结果的比较 A: KB Basecaller分析结果 B: LongTrace分析结果分析结果 常见问题 1. 很多数据读长超过800bp之后,分辨率比较低,经过 PeakTrace/Lontrace 重新分析后,能将读长增加10-200bp,使读长甚至超过1000bp,显著提高分辨率,那么增加的读长部分,比如800-100bp的部分,从分析后的峰图上看起来很准确,实际上这些数据可信吗? 经过PeakTrace/Lontrace重新分析的数据,增加的读长部分的碱基序列是可信的,可信度都是用Qscore来评价,可以在系统中进行设置,默认条件下是20,即进行basecalling的错误概率低于1%;如果要求更高,可以设置成为30,则进行basecalling的错误概率低于0.1。 通过实验也能进行验证,比如用序列拼接或者对DNA片断进行反向测序,用实验数据和系统重新处理的结果进行比较即可。目前,该系统已在国内外很多知名的实验室使用。 2. PeakTrace和LonTrace 有什么区别? PeakTrace和LonTrace都是提取原始数据重新进行数据处理, 区别在于PeakTrace进行 basecalling的方法是采用公司自主开发的新算法;而LonTrace是仍然采用KB Basecaller进行basecalling。所以,从处理之后的结果来看,PeakTrace处理之后的峰图的形状变化更大,优点是分辨率改善更明显。 ,,,
良好的兼容性
PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统适用于ABI 377,310,3700,3730,3730xl,3100和3130系统。
操作方便
直接将KB Basecaller分析的trace(扩展名为abi 或ab1的文件)导入PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统,经过短时间处理,系统将自动生成与处理前的trace同名的文件,并存入预先指定的文件夹中(注意:不要将处理结果与KB Basecaller分析的trace存入同一个文件夹)。
更高的读长,更少的错误
PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统从ABI KB Basecaller分析的trace中提取出原始数据,通过一系列zei新算法从头处理,能显著提高测序读长,减少错误,提高通量。
, ABI KB Basecaller 和PeakTrace分析结果的比较
ABI KB Basecaller 和LongTrace分析结果的比较
A: KB Basecaller分析结果
B: LongTrace分析结果分析结果
常见问题
1. 很多数据读长超过800bp之后,分辨率比较低,经过 PeakTrace/Lontrace 重新分析后,能将读长增加10-200bp,使读长甚至超过1000bp,显著提高分辨率,那么增加的读长部分,比如800-100bp的部分,从分析后的峰图上看起来很准确,实际上这些数据可信吗?
经过PeakTrace/Lontrace重新分析的数据,增加的读长部分的碱基序列是可信的,可信度都是用Qscore来评价,可以在系统中进行设置,默认条件下是20,即进行basecalling的错误概率低于1%;如果要求更高,可以设置成为30,则进行basecalling的错误概率低于0.1。
通过实验也能进行验证,比如用序列拼接或者对DNA片断进行反向测序,用实验数据和系统重新处理的结果进行比较即可。目前,该系统已在国内外很多知名的实验室使用。
2. PeakTrace和LonTrace 有什么区别?
PeakTrace/LongTrace DNA数据分析服务,
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