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宏基因组研究策略的出现,使得我们无需分离培养单个微生物,利用高通量测序技术即可对来自特定环境或人体部位的微生物群落展开全局研究。16S rDNA因其序列在物种间的高度多样性,成为细菌分类学研究的“分子钟”,其序列包含可变区和保守区,可变区因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关。16S rDNA测序是通过提取微生物菌群的DNA,选择可变区的特定区段进行PCR扩增,再结合高通量测序分析,帮助研究人员大规模鉴定细菌群落组成,表达丰度,以及开展系统进化分析,促进对微生物群落与环境互作,以及与人类互作的研究。 基于丰富的数据库,16S rDNA测序配合专门开发的数据分析程序可以将菌群鉴定精细到分类学上种(Species)的级别。在医学研究中,将菌群鉴定到种具有重要的临床应用价值,因为不仅可以鉴定出某种传染病的关键致病菌种,还可以帮助临床医生选择适合的抗生素,以及确定治疗持续的时间和制定传染控制程序。在农业生产中,牲畜、农作物的生长既离不开与菌群的共生作用,也时常受到多种不同病菌的侵染而影响发育,减产,甚至造成死亡,如能鉴定出引起某一病害的关键或是占主导的菌种,缩小致病菌范围,将显著促进开发出更有针对性的控制策略。然而,目前国内大部分的研究人员采用的技术方案或是科技服务仍普遍鉴定到属(Genus),这极大限制了对关键菌或优势菌展开进一步的功能研究。 技术优势 1. 国内首家提供16S rDNA测序菌群鉴定到“种”。 基于zei新版Greengene和自建数据库,结合自主开发的分析注释工具,目前zei多可鉴定4414个种,覆盖2106个属。 2. 国内率先提供16S rDNA双可变区(V3+V4)测序,扩增引物经过反复优化可以扩增出绝大部分已报道的细菌和古生菌,使菌种鉴定更丰富更准确。 3. 微生物多样性分析内容丰富,菌群鉴定、丰度与结构分析,系统进化分析等通通齐备。 一、样本要求 类型:完整无明显降解的总DNA 起始量:>1ug样本 浓度:>20ng/ul 二、服务周期 标准流程的服务周期约为60个工作日
宏基因组微生物多样性16S,
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