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技术简介:
SSR(Simple Sequence Repeats)标记是一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术,也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),又称为sequence tagged microsatellite site,简写为STMS,是目前zei常用的微卫星标记之一。
SSR是由几个核苷酸(一般为1~6个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。由于每个SSR两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列,因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序,然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增,从而将单个微卫星位点扩增出来。
实验内容:
1.引物设计与合成;
2.目的片段PCR扩增;
3.上机电泳;
4.结果统计。
提供材料:基因组DNA(≥20μl,浓度≥50ng/μl)。需提供目的SSR位点的rs号或该位点上下游各200bp的序列以及突变的类型。
交付结果:
1.完整实验流程报告;
2.LI-COR4300电泳胶图;
3.样品对应SSR位点的基因型(重复序列)。
SSR检测,
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