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16S rDNA(或16S rRNA):16S rRNA 基因是编码原核生物核糖体小亚基的基因,长度约为1542bp,其分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中zei常用和zei有用的标志。16S rRNA基因序列包括9个可变区和10个保守区,保守区序列反映了物种间的亲缘关系,而可变区序列则能体现物种间的差异。扩增子测序主要对特定长度的PCR产物进行测序分析,针对环境样本,16S测序是研究环境微生物多样性及群落组成的重要技术手段之一。
样品要求
1、样品需求量:0.6ug 以上。
2、样品浓度:≥5ng/μl,以 Qubit 质检结果为准。
3、样品纯度:OD260/280=1.8~2.0。
4、样品完整性:DNA 无降解,即电泳有明显的主带。
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交付结果
1.数据过滤质控及统计;
2.PE reads拼接;
3.Tags聚类成OTU,对其做PCA,韦恩图等。
4.通过数据库比对对 OTU 进行物种注释,绘制物种 profiling 柱状图、热图及系统进化树;
5.基于 OTU 聚类分析结果,对样品进行 Alpha 多样性分析;
16S rRNA_建库测序&标准分析,
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