生殖道微生物多样性分析
产品内容:
提供生殖道微生物多样性分析的整套方案:“实验规划 -> 样本采集 -> 肠道微生物序列测定 -> 生信统计学分析 -> 论文协助” 。
样品采集:
可为客户提供样品采集盒 。
检测平台:
Illumina 、 Ion PGM 、 PacBio 等高通量测序分析、 PCR-DGGE 、实时荧光定量 PCR 、克隆文库等多种微生物多样性分析平台。
送样要求:
不同的样本类型,送样要求不一样。
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生殖道 内微生态环境对妇女健康、生殖功能、婴儿出生等都有重要的作用。微生物导致生殖道环境产生某些生化或炎症反应,生育期健康女性的阴道内有大量正常寄生菌,他们通过自身产生的粘附机制与阴道上皮细胞结合,生长于阴道粘膜表面。其菌群的平衡至关重要,其不仅影响着其中定殖微生物类群,也影响着阴道内环境。而一旦受到某些因素的影响,如体内雌***含量的变化、致病菌的侵入、长期服用抗生素等,就会使阴道pH值发发生改变,破坏阴道的自然防护,其内部的菌群失衡,就会产生相应的疾病。
微基生物 运用分子生物学结合高通量测序的方法,可以得到生殖道中绝大部分微生物的信息,并通过生信/统计分析,对大量数据进行处理和分析,找到在生殖道中与环境因子(抗生素使用、细菌性炎症等)相关的微生物群落组成,从而进行进一步的研究。
微基生物进行人体健康相关的研究与应用:
其他微生态健康服务,可电话详询:。
微基生物提供与人体健康相关的生信/统计服务:
生殖道微生态分析流程
新鲜样品: 用无菌棉拭子,于女性阴道侧壁1/3处取阴道分泌物,将棉签置于无菌管中,保存于-80℃冰箱中
DNA样品: 样品需求量:≥ 300 ng;样品浓度:≥ 10 ng/μL;样品纯度:OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解
样品运送: 干冰寄运
Bioinfor-statistic analysis
案例分析
标题: 欧洲妇女产前和产后一段时间内阴道微生物的变化
研究领域: 生殖道微生物
分析物种: 细菌
(1)细菌多样性在产后妇女的阴道中明显增加
(2)在怀孕8周一直到产后,阴道微生物的在种水平上的组成变化图
(3)在英国妇女中,从产前至产后的整个过程中,阴道微生物类群的变化图(不同颜色代表不同的细菌种类)
(4)主要微生物类群在不同人种之间的差异
原文链接: http://www.nature.com/articles/srep08988
参考文献:
MacIntyre, D. A., M. Chandiramani, Y. S. Lee, L. Kindinger, A. Smith, N. Angelopoulos, B. Lehne, S. Arulkumaran, R. Brown, T. G. Teoh, E. Holmes, J. K. Nicoholson, J. R. Marchesi and P. R. Bennett (2015). “The vaginal microbiome during pregnancy and the postpartum period in a European population.” Sci Rep 5 : 8988.
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