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大胃王如何维持“完美”体形?Nature子刊:鲸鱼肠道微生物助力脂质消化


蛋白组 代谢组 多组学

鲸鱼作为海洋中最大的动物,每天捕食吨级的浮游生物和小型猎物,通过消化大量富含油脂的猎物,维持其能量密集型的生活方式,排出对海洋生物化学循环重要的营养物质。因此,鲸鱼对食物的消化反应是海洋食物链中能量、有机物和其他营养物传递的首要基础。那么鲸鱼是怎样消化这些“油腻”的食物的呢?胃肠道微生物这个过程是否起到了重要的作用呢?

为更好地了解这个问题,来自美国伍兹霍尔海洋研究所的研究人员在《The ISME Journal》 (IF=9.493)杂志发表“Coordinated transformation of the gut microbiome and lipidome of bowhead whales provides novel insights into digestion”的研究论文。作者通过组学手段对阿拉斯加爱斯基摩人捕获的38头弓头鲸(Balaena mysitetus)的126个消化道样本的脂类组成和肠道微生物进行了组学分析。结果表明,脂质的消化与鲸鱼胃肠道微生物菌群有很强的相关性。

研究路线

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研究结果

鲸鱼肠道的脂质变化与菌群变化显著相关

为了确定鲸鱼肠道微生物群与鲸鱼饮食中脂类消化的关系,作者收集了鲸鱼消化道前胃、小肠、大肠、结肠、回肠等区段的内容物,通过16S扩增子测序分析内容物中微生物种类及丰度情况,通过脂质组学分析脂质在不同消化道区段的变化。对微生物菌群差异及脂质组差异物分析发现,二者间存在极显著的相关性。因此推测,鲸鱼消化道微生物广泛参与了脂质的消化利用过程,且不同区域的微生物对不同脂质的消化作用存在显著差异。

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鲸鱼消化道内微生物群落组成和多样性

16S扩增子测序分析发现,鲸鱼胃肠道所有区段的相关细菌中,97%的细菌来自:硬壁菌(64%)、蛋白细菌(16%)、梭杆菌(12%)、拟杆菌(5%)。硬壁菌是胃部的优势菌类,而蛋白细菌和梭杆菌是小肠中的优势菌类,类杆菌是大肠中的优势菌类。胃腔中发现的核心菌群包括梭杆菌、鲸蜡杆菌、消化链球菌、乳球菌等。大肠核心菌群主要是梭状芽孢杆菌目,包括梭状芽孢杆菌、地芽孢杆菌、消化球菌等。综上,消化道不同部位之间微生物的群落变化显著,其中胃、小肠和大肠的群落差异最大,小肠存在明显的区域差异。

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鲸鱼消化道内脂质组成和多样性

已有研究表明,鲸鱼可以很好地消化富含高能量脂质的食物,从而提供能量补充或维持体内脂肪储备。为了研究鲸体内脂质成分消化过程,研究人员对鲸鱼胃肠道内容物的脂质组学结果进行了分析,检测到546种脂质,分属于蜡酯、甘油三酯、甾醇及甾醇酯、脂肪酸等八大类。其中,蜡酯和甘油三酯是鲸鱼胃腔内容物的主要脂质成分,表明弓头鲸所摄入食物的主要脂质成分是这两类。而甾醇和甾醇酯等脂质成分在消化道的下段含量急剧增加,尤其是小肠等区段,表明脂质在该区段富集。以上结果表明,蜡酯是弓头鲸胃肠道中最丰富的脂质,其含量随着在消化道向下端移动逐渐降低,因此推测蜡酯很有可能是在小肠的中远端被消化。

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鲸鱼对蜡酯的消化

鉴于蜡酯在许多海洋动物的“能源经济”中所起的主要作用,而且数据表明,蜡酯至少储存了全球海洋初级生产产生的一半碳,因此阐明鲸鱼是如何促进这一重要海洋脂质循环过程,是一个非常有意义的课题。基于此,作者分析了鲸鱼消化道不同部位蜡酯含量差异。蜡酯在总脂质占比表明,胃部和十二指肠壶腹(小肠开始时的腔室)中蜡酯类的平均相对丰度最大,整个小肠中蜡酯类的平均相对丰度稳定下降,回肠和近端大肠中蜡酯脂质类的平均相对丰度最低,不同解剖部位蜡酯的相对丰度分布存在显著差异。与第一胃腔中的蜡酯丰度相比,消化道远端之间的相对丰度显著降低50%以上。与近端肠中甘油三酯显著减少不同,蜡酯直到小肠末端才达到最低丰度。因此,无论是因为食用量大还是其化学性质,蜡酯可能需要更多的时间或暴露于小肠的物理化学/生物特性中,以便在头鲸体内消化。另外作者观察到放线杆菌(MED4152)和鲸杆菌属(MED4350)与空肠中的蜡酯丰度相关,暗示这些肠道微生物有助于蜡脂消化。

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结论

作者利用转录组学和代谢组学分析,揭示了Se1基因损伤会影响淀粉代谢,导致蔗糖和麦芽糖积累,从而影响玉米的甜味。后期功能验证进一步证实了Se1沉默对皱缩籽粒表型和麦芽糖含量增加的因果效应。碳水化合物,主要是淀粉,是全球谷类作物的重要产品,对农产品的产量和品质均有重大影响,但影响籽粒组成成分和遗传网络的机制还不完全清楚。因此,深入了解淀粉代谢和调控的机理基础,对于满足未来农业和工业的应用需求具有十分重要的意义。

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