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用户视野 | 探索单细胞蛋白质组学,timsTOF SCP鼎力相助


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基于质谱的蛋白质组学已成为研究生物功能和疾病机制的主要工具。健康或疾病组织看起来是同质的,但其蛋白质组成可能是截然不同的。就癌症而言,癌组织中部分癌细胞具有更强的转移性,这部分癌细胞更适合作为特定药物的靶点,因此破解每个细胞中的蛋白质组的差异(细胞异质性)是充分理解其功能的关键。

视频专访:Helmholtz Zentrum München组织工程与再生医学研究所

Helmholtz Zentrum München组织工程与再生医学研究所Ali Ertürk教授课题组利用timsTOF SCP结合DISCO技术(通过有机溶剂清除脂肪和色素,把小鼠的身体变透明,再使用染料标记的纳米抗体来增强荧光蛋白信号,就可以看到动物体内细胞),可以对肿瘤组织中发生转移的单个癌细胞进行全蛋白质组分析,有助于了解不同类型肿瘤发生及转移过程,并助力开发出抑制这些转移进程的肿瘤特异性药物。Ertürk教授表示,超高灵敏度的timsTOF SCP可以帮助他们对单个肿瘤细胞完成蛋白质组的深度覆盖,实现真正的以小见大,见微知著。

timsTOF SCP 采用了一个全新改进的离子源几何设计,结合平行积累连续碎裂(PASEF®)采集方法的优势,提供了超高灵敏度和超快采集速度,可从单个细胞中发现细胞异质性和生物学特性,以应对单细胞蛋白组分析的挑战。