新一代高通量单细胞测序系统

10x Genomics自2016年进军单细胞领域以来，最开始以经典款仪器——Chromium Controller不断开发新应用，解锁单细胞多组学。随后，为了解放科研人员的双手，减少人为误差，又推出了单细胞捕获自动化工作站—— Chromium Connect。然而，就在最近，为了满足科研工作者对更高通量单细胞捕获的需求，10x 推出了Chromium X，即百万单细胞捕获的神器，带您探索更多可能！
 

为什么要用百万单细胞捕获神器——Chromium X？

当10x Genomics的Chromium Controller问世以来，科学家就惊叹于它的高通量，一次上机，八个通道，最高通量可做到捕获8万个单细胞。如此高的通量和单细胞分辨率大大提速了科研工作者的研究，新的发现，新的成果层出不穷，高分文章发发发不停！
 

但是，通过对近几年单细胞文章捕获的细胞数量的统计，我们也会发现，现在文章中所涉及到的细胞数目也越来越多了，更多的单细胞数据，有助于我们拿到更好的实验结果。
 

并且，在我们面对一些特定的科学问题的时候，我们确实是需要百万级别的单细胞才能解开一个真相，比如说：

1. 人类器官图谱构建。对于一个器官而言，其细胞的多样性绝不是几万甚至几十万个细胞就能彻底描绘的，我们需要做到百万级别的细胞数量，才能全面的描绘一个器官所有的细胞类型，这个时候，Chromium X无疑是我们更好的选择！

2. CRISPR筛选。在CRISPR单细胞筛选的过程中，一般需要将一种gRNA导入到80-100个细胞中，然后看其对基因的扰动。如果我们有一个1万条gRNA的库，那么我们就需要捕获百万级别的单细胞来进行CRISPR筛选，这个时候，Chromium X将是我们研究的利器！

3. T/B细胞克隆亚型分析。对于免疫研究的老师，大家都知道TCR/BCR的克隆亚型极其丰富，如果我们只测几万个细胞，是很难覆盖所有的克隆亚型的，这个时候，Chromium X将给您带来更大的帮助！
    

更重要的一点是，如果您使用Chromium X进行高通量单细胞捕获，还可以大大降低单个细胞的捕获成本。
 

Chromium X，捕获原理是什么？

Chromium X的单细胞捕获原理还是基于Next GEM的微流控捕获原理，细胞和反应试剂及Geal Beads被包裹在一个油滴里。每个油滴形成一个微反应体系，同细胞里的RNA被标记上相同的10x Barcoded。测序后，对单细胞数据进行拆分。不过，Chromium X有16个通道，每个通道最多可以捕获2万个单细胞。此外，现在10x Genomics的仪器还支持混样（CellPlex），一个通道最多可以混12个样本（混样的原理是在细胞上加脂质标签：https://pages.10xgenomics.com/rs/446-PBO-704/images/10x_LIT000106_Product_Sheet_Single_Cell_Gene_Expression_CellPlex_Letter.pdf），混样后，一个通道最多可以拿到4.6万个单个细胞，一次上机，最多可以拿到73万个单个细胞（该数字是去除双细胞拿到的最终单个细胞数量）。双细胞捕获率为0.4%/1000个细胞。上机一次运行的时间不超过18min。此外，X还加入了温控装置，确保拿到的数据质量更高。
 

Chromium X，可以做哪些应用？

高通量版本的Chromium X，不仅可以实现之前的Chromium Controller的单细胞3端转录组解决方案，同时还可以进行细胞表面蛋白的检测，CRISPR单细胞大规模筛选，靶向捕获，及混样（CellPlex）；还可以实现基于5端RNA捕获的单细胞免疫组解决方案，检测单细胞全长配对的VDJ序列，细胞表面蛋白检测，抗原特异性检测，靶向捕获，CRISPR筛选（2022年推出），混样（2022年推出）。此外Chromium X还可以兼容Chromium Controller 的试剂和芯片。也就是说，您可以直接将八个通道的Chromium Controller芯片用于Chromium X上，并且这个时候，我们就可以在Chromium X上实现Chromium Controlle的所有应用，如单细胞ATAC，单细胞ATAC+mRNA等。
 

Chromium X 物理参数展示

• 重量 ：18.8 kg

• 体积：宽 x 深 x 高=28.6 厘米x 48.3 厘米x 27.3 厘

• 电气要求：100–240 VAC, 50/60 Hz, 250 W，90–264 V 工作范围（额定值的 +/- 10%），过压类别 II（标准插座）

• 工作温度：18–28°C

• 湿度：30–80% R.H. 非冷凝

• 海拔高度：0-2286 米

• 电源线长度：2 m-包括特定国家/地区的适配器
   

Chromium X 数据展示
 

10x内部数据测试，在Chromium X上用Chromium Controller的芯片和试剂（可以叫做标准试剂芯片）进行单细胞转录组，免疫组，ATAC及ATAC+mRNA的实验，然后与Chromium Controller仪器上获得的数据进行对比，发现二者的相关性系数很高，说明Chromium X完全兼容Chromium Controller的芯片和试剂，所以大家不必有顾虑！

此外，10x还在Chromium X上做了使用高通量试剂芯片和标准试剂芯片的数据比较。实验中使用新鲜骨髓穿刺样本，获取单细胞悬液，用130个抗体进行孵育，然后过流式筛选孵育上抗体的细胞，然后分别进行Chromium X高通量单细胞捕获和Chromium X标准通量捕获，最终标准通量捕获到8269个细胞，高通量捕获到17581个细胞，然后进行单细胞转录组，VDJ，细胞表面蛋白的检测。
 

根据检测结果，我们发现，高通量捕获的细胞数量多，更能检测出一些稀有的细胞类型，以及低丰度的TCR克隆亚型。

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