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参考报价: | 面议 | 型号: | 肿瘤相关基因经典研究方案 |
品牌: | 辉园苑 | 产地: | 广州 |
关注度: | 33 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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从大数据中挖掘出与肿瘤相关的基因,主要包括mRNA,miRNA, lncRNA等,按照临床相关性分析、细胞株构建、细胞功能实验、裸鼠成瘤模型、高通量测序的经典套路进行研究。首先发现A基因与C疾病临床相关,证明A基因影响细胞的D功能,进一步揭示A基因通过B通路影响细胞的D功能。验证靶标分子与临床病理的相关性,同时深入研究其作用的分子机制,能够深入开展与肿瘤发生、进展分子基础相关的研究,获得富有价值的科研成果。
研究流程
1.发现A基因与B疾病临床相关
从TCGA、Taylor等基因芯片数据库中下载数据,进行生物信息学分析,挖掘肿瘤相关基因A,并通过临床组织芯片实验验证。
2.细胞株构建
构建过表达、抑制or 敲除细胞株。
3.细胞实验
主要包括CCK8、Transwell、woundhealing、流式细胞凋亡凋亡、流式细胞周期等。
4.体内实验
裸鼠皮下接种细胞株形成裸鼠皮下移植瘤模型,分析基因A在体内对某肿瘤的成瘤、生长的影响;并通过免疫组织化学的方法分析基因A对肿瘤增殖、转移、凋亡等方面的影响。
5.高通量组学
GO分析、KEGG分析、Heatmap热图、基因-基因相互作用网路、靶基因预测等
6.调控机制证明
常见的调控机制:miRNA调控靶基因:3’UTR;转录因子调控靶基因:CHIP-PCR;LncRNA调控蛋白;蛋白与蛋白相互作用。
参考文章
Cai C, Chen QB, Han ZD, et al. miR-195 Inhibits Tumor Progression by Targeting RPS6KB1 in Human Prostate Cancer. Clin Cancer Res 21(21):4922-4934, 2015.
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