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工商注册信息已核实!参考报价: | 220 - 300 RMB(人民币) | 型号: | 菌种鉴定 |
品牌: | 艾基生物 | 产地: | 广州 |
关注度: | 8 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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细菌16S区序列分析
服务介绍
细菌的rRNA包括5S、 16S、 23S,其中5S rRNA信息量少,不适合分析。23S rRNA尽管分子大,信息量多,但碱基突变速度较快,同样不适用于细菌鉴定。16S rDNA是编码原核生物核糖体小亚基rRNA(16S rRNA)的DNA序列,相比之下遗传较为稳定,长度在1550±200 bp左右,代表信息量适中,可以用于研究系统进化。目前已经报道了10,000种以上的细菌16S rDNA序列。
16S rDNA结构示意图
技术路线
送样要求及注意事项
基因组DNA: OD 260/280 在1.8~2.0之间(OD260/230最好大于1.5),浓度≥30ng/μl,体积≥20μl,且无明显降解;
建议提供培养过的菌液,体积>2ml,请确保您提供的菌液是经过分离培养的单菌落,因样本不纯造成的测序双峰,我们将全额收取实验费用;
特殊样品,如放线菌、厌氧菌等,请直接提供基因组DNA,革兰氏阳性菌,建议提供基因组DNA
不接受有致病性的样品;
如果菌体带有致病性,请提供菌体的基因组DNA,并进行加热处理以杀死致病菌。
由于有些真菌形态与细菌相似,难以判断,在无法获得16S rDNA 结果时,建议考虑进行真菌ITS区序列分析;
对于测序双峰的样本,我们可以提供克隆测序的服务。
数据报告
测序峰图及序列文件
16S rDNA序列拼接文件
序列分析比对结果
服务价格
*对于测序双峰的样品,我们可提供克隆测序服务,价格:300元/样品
包含:片段克隆,4个阳性克隆测序,序列比对分析
真菌ITS区序列分析
服务介绍
真菌基因组中编码核糖体RNA的基因有4种,28S rDNA、5S rDNA、18S rDNA和5.8S rDNA,其中 18S、 5.8S和 28S rDNA基因组成一个转录单元,其间的间隔区为ITS (Internal Transcribed Space) 基因,包括ITS1及ITS2两部分。ITS区基因进化速度快,具有多态性,适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。利用rDNA的保守序列设计引物,PCR扩增未知真菌的ITS区,测序后与GenBank中已知的序列进行同源性比较,将未知真菌鉴定到属或种。
ITS区结构示意图
技术流程
送样要求及注意事项
基因组DNA: OD 260/280 在1.8~2.0之间(OD260/230最好大于1.5),浓度≥30ng/μl,体积≥20μl,且无明显降解;
建议提供培养过的菌液,体积>2ml,请确保您提供的菌液是经过分离培养的单菌落,因样本不纯造成的测序双峰,我们将全额收取实验费用;
特殊样品,如酵母菌、丝状真菌等,请直接提供基因组DNA;
不接受有致病性的样品,如果菌体带有致病性,请提供菌体的基因组DNA,并将其进行加热处理以杀死致病菌;
由于有些细菌形态与真菌相似,难以判断,在无法获得ITS结果时,建议考虑进行细菌16S区序列分析;
对于测序双峰的样本,我们可以提供克隆测序的服务。
数据报告
测序峰图及序列文件
ITS 序列拼接文件
序列分析比对结果
服务价格
*对于测序双峰的样品,我们可提供克隆测序服务,价格:300元/样品
包含:片段克隆,随机挑选4个阳性克隆测序,序列比对分析
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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途