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青莲百奥DIA定量蛋白质组学

参考报价: 面议 型号: DIA定量蛋白质组学
品牌: 青莲百奥 产地: 北京
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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

DIA技术(data-independent acquisition,数据非依赖采集)融合了传统蛋白质组shotgun的较高通量和质谱定量金标准PRM的定量较准的优点,被Nature Methods杂志评为2015年值得关注的技术。


技术原理

传统的蛋白质组技术shotgun、Label free、iTRAQ/TMT等在数据采集过程中存在较高的数据丢失和采集的随机性即DDA(data-dependent acquisition)的采集方式。在这个采集过程中,每个扫描周期内, 质谱只对丰度较高的信号进行二级信号采集,其余信号的二级信号则丢失了。

而DIA(data-independent acquisition)技术原理是将所有的信号预先划分为几块,然后对每块区域里面的所有一级信号,全部一次性进行二级采集。从而实现了多方面的覆盖性,以及在此基础上的重现性。

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DIA模式下的信号采集窗口展示


DIA技术优势

1. 稳定性较好:与传统的DDA采集模式相比,是无偏好的全息扫描,获得的信息丰富,解析出的蛋白较普通LFQ方法多,稳定性比较好,缺失值相对较少。

2.定量准确度较高:定量准确度与PRM技术相当。

3.适用范围广:单个样本上机,能进行一定程度上的有或无鉴定,能用于不同组织类型蛋白表达谱的比较。

4.时间跨度大:样本中加入了保留时间校正的标准肽段,不受上样时间限制,能够对不同时间上机的样本进行保留时间校正后,进行整体数据分析,更适合大样本量,疾病类样本。


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