转录组lncRNA 测序（含 mRNA-seq）

长链非编码（Longnon-coding RNA，LncRNA）是长度大于200个核苷酸的非编码RNA，其在细胞内数量比较多，大约是为mRNA的3-100倍。LncRNA与细胞周期、分化以及个体发育、生殖、性别调控、衰老、疾病等密切相关。LncRNA作用机制多元，一直是研究的热点。

lncRNA主要研究策略（可根据以下作用机制进行具体科研分析）：

1、编码蛋白的基因上游启动子区转录，干扰下游基因的表达；

2、抑制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及组蛋白修饰，影响下游基因（蓝色）的表达；

3、与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，干扰mRNA的剪切，形成不同的剪切形式；

4、与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，在Dicer酶的作用下产生内源性siRNA;

5、与特定蛋白质结合，lncRNA转录本可调节相应蛋白的活性；

6、作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体；

7、结合到特定蛋白质上，改变该蛋白质的细胞定位；

8、作为小分子RNA（如miRNA、piRNA）的前体分子。

测序分析内容：

1、数据产出统计和质量评估；

2、序列比对与拼接；

3、lncRNA表达丰度统计与表达水平分析；

4、差异性lncRNA的筛选及验证；

5、预测结合的mRNA；

6、GO富集及KEGG分析。

技术参数：

1、样本类型：细胞、全血、组织等

2、推荐数据量：12M clean reads

3、测序策略：HiSeq PE150

RNA测序分析研究案例：从测序到投Nature旗下期刊文章3个月

研究人员培养并工程化改造了牛角膜内皮细胞，使其发生上皮-间质转化，并研究该过程中细胞内各通路的变化，确定其机制，其中最关键的一步就是对样品进行转录组测序。然而因牛育种过程不同使得个体差异大，且注释不完善，属于典型的非模式物种个体，使用传统的算法根本无法对测序数据进行准确的分析。2016年11月初送样到承启生物，使用本公司自主研发的FANSe算法进行高容错mapping，可得到能被实验完美认证的差异表达基因，进而指导进一步的功能验证实验，最终实验顺利获得成功。该研究人员从对测序分析结果出来、所有表型功能实验全部完成、文章写作投稿到接收录用仅用了三个月的时间，可谓快！准！狠！避免了反复实验造成的时间、人力和财力浪费！

转录组lncRNA 测序（含 mRNA-seq）信息由承启医学（深圳）科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于转录组lncRNA 测序（含 mRNA-seq）报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途