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MALDI-TOF MS有望实现浮游动物快速鉴定

发布时间: 2019-05-16 09:04 来源:融智生物科技(青岛)有限公司

甲壳类动物是淡水浮游动物的重要组成部分,它们连接了各种营养级别。由于甲壳类动物,尤其是水蚤属的枝角类动物,对环境变化很敏感,因此它们可以作为环境波动的指标。然而,枝角类物种的采样程序和形态学鉴定是非常耗时的,并且需要经验丰富的水生生物学家。因此,要研究这种复杂的水生关系网络,必须采用一种能够快速可靠地监测淡水浮游动物组成的方法。

据报道,不同种类的分子方法已经被引入用于明确的物种确定,这些技术中多数都是基于DNA序列分析。另一种方法则是使用基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术的蛋白质分析技术,该技术广泛应用于微生物如细菌、酵母和病毒等的鉴定。最近,MALDI-TOF MS蛋白质分析也被报道用于后生动物鉴定。

布拉格化学与技术大学的研究人员,使用MALDI-TOF MS(基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱)蛋白质分析方法对中欧淡水样品中的单个水蚤进行了快速、经济、明确地鉴定。

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D. curvirostris(A)和D. longispina(B)的显微镜图片,用于形态学鉴定。

研究人员首先对各个样品进行了形态学鉴定。然后,使用MALDI-TOF MS(基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱)通过蛋白质组指纹对样品进行分析,获得的质谱用于创建参考数据库。数据库建成之后,研究人员对未知的物种进行了鉴定。研究人员还通过主成分分析(PCA)验证了各个水蚤物种的光谱之间的可变性。

研究结果表明, 使用MALDI-TOF MS(基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱)蛋白质组指纹技术与PCA 结合, 具有相当大的潜力,可以在不需要专家进行耗时的形态学分析的情况下, 作为明确识别单个淡水浮游动物物种的快速工具。这种方法有可能用于各种地区和季节的大规模浮游动物筛查。当然,浮游动物的快速鉴定也使得MALDI-TOF MS(基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱)的应用进一步得以扩展。

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)成功地使质谱得以分析生物大分子,并因此获得2002年诺贝尔化学奖。目前,MALDI-TOF MS已应用于微生物鉴定、肿瘤标志物测定、生物组织成像等领域。

通过对传统MALDI-TOF MS光、机、电、软等全方位的重新设计与研发,融智生物新一代宽谱定量飞行时间质谱QuanTOF不但具备传统MALDI-TOF MS拥有的所有能力,同时在定量、大分子检测、宽谱分析以及质谱成像等方面都有质的提升,是满足临床定量分析需求的MALDI-TOF MS产品。新一代宽谱定量飞行时间质谱QuanTOF分析平台,同样也为MALDI-TOF MS拓展了更广阔的应用领域。


标签:MALDI-TOF 浮游动物
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