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两大质谱法相结合 揭示犬口腔肿瘤新候选蛋白标记

发布时间: 2019-04-10 11:05 来源:融智生物科技(青岛)有限公司

随着人民生活水平的提升,养犬的数量也逐年增加。喂食、生活环境等的变化,使得肿瘤成为老年犬最主要的致死原因。包括高侵袭性和转移性口腔黑色素瘤(OM),非扁桃体口腔鳞状细胞癌(OSCC)和良性肿瘤(BN)在内的口腔肿瘤,是犬类的常见肿瘤。尽管这些肿瘤表现不同,但相关证据已显示出其蛋白质表达谱的有限数据,特别是在蛋白质组水平。

泰国朱拉隆功大学的研究人员使用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)两种方法,对犬类常见的口腔肿瘤进行了蛋白组学的研究,表征了肽质量指纹(PMFs),并鉴定OM、OSCC、BN和正常对照受试者的潜在蛋白质候选物,以寻找化疗药物与疾病扰乱的蛋白质之间的关系。

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黑色素瘤 (A)、羊膜黑色素瘤 (B)、分化良好的鳞状细胞癌 (C)、分化不良的鳞状细胞癌 (D)、上皮细胞癌 (E) 和成釉细胞瘤 (F) 的组织病理学特征。

研究结果显示,每个样本组都有一个独特的聚类,以及具有特定蛋白质候选物的独特肽质量指纹(PMFs)。在早期口腔黑色素瘤(OM)中观察到在囊蛋白分子伴侣(SACS)的2,274Da处的独特肽片段,而在早期和晚期OM中呈现了钠电压-门控通道α亚基10(SCN10A)的1,958Da处的片段。Notch1的2,316Da处的肽质量出现在早期OM和良性口腔肿瘤中,而肽质量2,505Da的谷氨酸离子型受体N-甲基-D-天冬氨酸型亚基3A(GRIN3A)在所有组中都被鉴定出来。GeLC-MS/MS的标记表达蛋白包括: 良性肿瘤中含有1C (JMJD1C) 的Jumonji, OM中的传代素 (INVS) 和 rho 鸟嘌呤核苷酸交换因子 28 (ARHGEF28),OSCC中的BTB结构域16(BTBD16),以及所有癌症组的蛋白酪氨酸磷酸酶非受体1型(PTPN1)、BRCA2、DNA修复相关(BRCA2)、WW域结合蛋白2(WBP2)、嘌呤能受体P2Y1和蛋白酶体激活子亚基4(PSME4)。

研究还证实了这些蛋白质与化疗药物顺铂和阿霉素、环磷酰胺和吡罗昔康之间的网络连接。总之,这项研究揭示了犬口腔肿瘤的独特肽质量指纹(PMFs)和新候选蛋白标记。对于未来的工作,研究人员表示,疾病中的蛋白质-蛋白质相互作用则应通过高通量方法确认,例如酵母双杂交筛选和亲和纯化与质谱联用。

 在生命科学领域,随着分子生物学、蛋白质组学、代谢组学等学科的飞速发展,越来越多的生物标志物与疾病间的关系逐渐被建立和明确,这将十分有利于疾病的发现与治疗。当然,对于犬类等动物来说也不例外,虽然目前生物标志物的研究还比较少地聚焦在动物身上。无论如何,生物标志物的定性和定量分析,在临床上可以作为重要的辅助诊断手段。

融智生物新一代宽谱定量飞行时间质谱QuanTOF以其宽质量数高灵敏度分析以及开拓性的定量分析能力(定量精度达98%以上),使得质谱用于分析生物标志物成为可能。QuanTOF可以进行从代谢产物(小分子)到抗体蛋白(大分子)的定性和定量分析,灵敏度可达fmol,操作简单高效,可实现样本多指标同时分析,减少检测成本,提升检测效率。QuanTOF使得MALDI-TOF质谱可用于临床。


标签:犬 口腔肿瘤 蛋白标记
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