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修饰蛋白+靶向代谢联合分析

参考报价: 面议 型号: 修饰蛋白+靶向代谢联合分析
品牌: 中科新生命 产地: 上海
关注度: 640 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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生命的基本特征是新陈代谢,生命的功能执行者是蛋白质,蛋白质表达水平及翻译后修饰可以通过多种方式调控生理过程,影响机体代谢变化。研究发现,乙酰化、磷酸化、泛素化等多种修饰是代谢调节的关键机制,其不仅通过修饰转录因子间接调控代谢基因的表达,更是通过修饰代谢酶直接调控代谢流量。因此,修饰已成为代谢机制研究的最重要方向,而“代谢组”与“修饰组”更是打通表型与机制的最有效研究手段。在联合分析中,我们将围绕表达模式、生物学功能、调控机制这三个关键因素,解析如下科学问题:(1)比较蛋白翻译后修饰、代谢物的表达模式异同,揭示其在生物学处理后的不同层面的变化趋势的异同。(2)筛选差异修饰蛋白、代谢物共同参与的重要通路,揭示其在相关生物学变化中的潜在功能。(3)分析蛋白质翻译后修饰与代谢物的调控关系,阐述蛋白质翻译后修饰与代谢物间的潜在调控机制。

应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

▶ 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

数据分析

数据分析

▪ 表达模式分析:

修饰蛋白质组与代谢组PCA比较分析

▪ 修饰蛋白质组与代谢组通路联合分析:

KEGG代谢通路注释比较分析、 KEGG通路富集比较分析、 KEGG富集通路的差异表达谱、 KEGG通路可视化

▪ 修饰蛋白质组与代谢组调控关系分析:

相关性分析(相关系数矩阵热图、相关性分析层次聚类热图、相关系数调控网络分析)

▪ 修饰蛋白质组与代谢组调控关系分析:

多变量统计学整合分析( O2PLS关联分析、OPLS相关变量的筛选)

技术优势

▶ 通过对不同层面的表达水平分析,实现对修饰蛋白质及代谢物的全谱分析。

▶ 同时实现从“因”和“果”两个方向探究生物学问题,相互间的验证作用更明显。

▶ 阐述分子调控-表型间的关联机制,系统全面地解析生物分子功能和调控机制。

▶ 从海量的数据中去伪存真,筛选出重点代谢通路或者基因、代谢产物进行后续深入实验分析与应用。

参考文献

1. Maximal oxidative capacity during exercise is associated with skeletal muscle fuel selection and dynamic changes in mitochondrial protein acetylation. Cell Metab. 2016

本文揭示了体能与代谢和乙酰化修饰的重要关系。代谢组研究发现,高运动能力大鼠表现出更加高效的运动燃料选择,其糖原消耗延迟,脂肪酸消耗增强,支链氨基酸利用率增强。修饰组研究发现,高运动能力大鼠具有更强的线粒体蛋白去乙酰化能力,而该去乙酰化能力可能是驱动高效燃料选择的原因。


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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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