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真核无参转录组测序

参考报价: 面议 型号: 真核无参转录组测序
品牌: 中科新生命 产地: 上海
关注度: 673 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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基于Illumina 测序平台,真核无参转录组测序采用Illumina Hiseq平台,对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有RNA进行测序,拼接出最长的转录本为unigene,以unigene为参考序列进行转录本拼接、注释,全面分析基因表达水平和结构信息。

实验流程



转录组测序

应用方向

生物领域各个研究方面,如:

▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

▶ 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

▶ 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

数据分析

转录本拼接组装基因表达水平定量
基因功能注释(7大数据库)样品间相关性分析
CDS预测基因差异表达分析
SNP分析、Indel分析差异表达基因功能富集分析
SSR分析差异表达基因的蛋白质互作网络分析
转录因子注释个性化分析

技术优势

▶ 样品类型广泛:动植物组织、微生物、细胞、外泌体等;

▶ 质控严格:严格的质量控制,及时与客户沟通RNA质检结果;

▶ 平台优,数据质量高:基于优质的Illumina测序平台,建库成功率>98%,数据质量高,Q30>85%;

▶ 分析内容丰富:个性化分析,联合分析,分析内容更丰富。

参考文献

1. Prediction of a peptidome for the ecotoxicological model Hyalella azteca (Crustacea; Amphipoda) using a de novo assembled transcriptome. Mar Genomics. 2018

无参转录组测序技术-端足虫-通过对端足虫转录组分析,为生态毒理研究奠定良好的基础。

2. De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evol Biol. 2017

无参转录组测序技术-鲸鱼-通过对灰鲸基因组和转录组分析,更好地了解鲸鱼的进化及其适应低氧环境的机制。


真核无参转录组测序信息由上海中科新生命生物科技有限公司 为您提供,如您想了解更多关于真核无参转录组测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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