DIA客户文章合集|你和SCI间可能只差一个DIA蛋白组

金桂飘香的九月，充满了收获的喜悦。自DIA蛋白质组学服务推出以来，得到广大科研老师的青睐。2020年是中科新生命DIA服务收获满满的一年，陆续收到老师们反馈的研究成果，纷纷都运用DIA蛋白质组学技术，涉及代谢类疾病、神经精神类疾病、感染类疾病、免疫性疾病以及食品科学等研究领域。小编将收录的中科新生命客户DIA项目文章做了汇总，供大家参考。

文章题目：Low-Dose Sorafenib Acts as a Mitochondrial Uncoupler and Ameliorates Nonalcoholic Steatohepatitis.

影响因子IF：22

发表期刊：Cell Metabolism    

发表时间：2020.05

合作单位：武汉大学               

研究对象： 小鼠模型、食蟹猴

产品类型：DIA、磷酸化labelfree

关键词：低剂量索拉菲尼、肝脏组织、非酒精性脂肪肝 

非酒精性脂肪肝（NASH）是引起肝癌的主要因素之一，但是目前对于NASH尚无特殊治疗措施。索拉非尼（Sorafenib）是晚期肝细胞癌（HCC）一线的首要治疗药物，抑制细胞增殖，引起细胞凋亡抑制肿瘤生长，且具有抗纤维化的作用。该项研究使用不到临床推荐的10%的剂量早期给药，发现低剂量的索拉菲尼非常显著地降低了小鼠肝癌发生率，并且显著抑制了小鼠的非酒精性脂肪肝炎（NASH）的进展。通过转录组、蛋白质组及磷酸化组的大规模分子层面研究，揭示了小鼠模型组织作用机制，主要是通过激活AMP活化蛋白激酶（AMPK）通路影响脂质积累和炎症，并且在食蟹猴模型上再次验证小剂量索拉菲尼高效低毒的治疗效果。

构建高脂和高胆固醇饮食（HFHC）和二乙基亚硝胺诱导（DEN）的小鼠并通过表型检测。结果发现低剂量的索拉菲尼可以有效改善高脂饮食引起的体重、肝脏重量以及肝功能相关指标（ALT 和AST）。通过分子水平研究发现主要调节的功能集中于脂代谢、炎症以及纤维化等方面， 主要作用机制是索拉菲尼显著激活了AMPK信号。

文章题目：DIA proteomics reveals hypotensive and immune-enhancing constituents in buffalo whey from different altitudes

影响因子IF：5.1

发表期刊：International Journal of Biological Macromolecules 

发表时间：2020.08

合作单位：云南农业大学

研究材料：水牛牛奶

产品类型：DIA+PRM     

关键词：水牛牛奶、海拔、 降血压、免疫 

鲜牛奶中的活性及功能成分对于功能奶具有重要的意义，然而不同海拔地区的水牛中的牛奶成分是否有差别尚未有深入研究。该项研究以高中低不同海拔的水牛牛奶为研究材料，通过DIA和PRM蛋白质组学技术，发现高海拔地区的水牛牛奶蛋白组成中，含有较少的血管紧张素原，较多的免疫增强活性成分。而低海拔地区的水平的乳清中含有富硒蛋白及淋巴细胞抗原。该项研究表明高海拔水牛和低海拔水牛的乳清蛋白分别可开发为降血压及提高免疫牛奶，对于食品科学研究领域的应用提供了理论支持。

通过不同海拔的地区来源的水牛牛奶的蛋白质组学分析，发现不同海拔地区的分组具有明显的分离趋势，说明牛奶成分组成具有较大的差异。对差异的部分蛋白进行靶向验证之后，可以得到和DIA组学相似的表达趋势，说明在组间确实存在表达差异。

文章题目：Serum sCD14, PGLYRP2 and FGA as potential biomarkers for multidrug-resistant tuberculosis based on data-independent acquisition and targeted proteomics

影响因子IF：4.5

发表期刊：J Cell Mol Me

发表时间：2020.09

合作单位：浙江大学

研究材料：血清

产品类型：DIA+PRM     

关键词：肺结核病、耐药、标志物

多耐药性结核病（MDR-TB）是全球性结核病控制的主要难题，然而对于该疾病的诊断和预防仍面临巨大的挑战。本研究采用的DIA+PRM的蛋白质组学技术，进行耐药结核组及敏感结核组的血清样本队列进行蛋白层面检测，寻找耐药结核病的诊断方法。通过分析发现三个潜在生物标志物，sCD14,PGlyrp2和FGA,并通过诊断模型发现诊断灵敏度为81%，特异性90%。该研究结果为开发耐药结核病的新型诊断方式及耐药机制的研究提供了一定的参考依据。

对部分蛋白在各组（耐药组，敏感组及健康组）的表达量比较，通过箱线图展示，可见sCD14,PGLYRP2和FGA等蛋白表达在各组间具有明显的差异。通过ROC分析对诊断特异性和灵敏性进行分析，发现筛选到的差异标志物组成的panel具有较好的特异性和灵敏度, AUC 值达到0.913，灵敏度为94.7%,特异性为80%，优于单个蛋白所建立的诊断模型。

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DIA技术由于其无偏见全覆盖的扫描模式，具有传统组学技术无法超越的定量稳定性以及重复性等特点，在CNS期刊中的应用越来越火热。中科新生命自提供DIA技术服务以来，不仅在常规样本的大队列样本检测方面积累了大量的经验，也可提供一站式的标志物研究DIA+PRM+机器学习服务，基于肿瘤的蛋白基因组分型研究以及常规机制研究的完整解决方案。感兴趣的老师欢迎来咨询！