ASMS 2020 DIA / DIA磷酸化相关报告精彩回顾

ASMS 2020 Biognosys讲座第一场

1）DIA及DIA磷酸化蛋白质组，实现信号通路等相关研究更全覆盖

“High-Throughput and Sensitive (Phospho)Proteomics Using FAIMS and directDIA”

Prof. Dr. Jesper Velgaard Olsen

Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, University of Copenhagen

蛋白磷酸化是深入理解细胞过程、健康或疾病信号转导的重要修饰类型。基于磷酸化定量蛋白质组的传统质谱方法在稳定性、覆盖深度等瓶颈，仍困扰着信号机理研究人员，尤其是大队列临床样本的磷酸化修饰分析，依然是较大的挑战。

来自哥本哈根大学Jesper V. Olsen教授基于FAIMS480的蛋白质组及DIA磷酸定量分析流程，在全新DirectDIA2.0加持下与相关实验条件优化下，实现21分钟短梯度40000个unique 肽或15000个unique磷酸化肽的定量。对于进一步推动磷酸化在细胞信号网络中的研究，如药靶筛选、激酶分析、浓度及时间梯度处理的实验，以及临床大队列样本的分子分型等，具有巨大的应用价值。

2）DIA优化：BOXCAR DIA和diaPASEF技术

“Advances in Data-independent Acquisition Strategies: BoxCar-DIA and diaPASEF”

Prof. Dr. Florian Meier (Functional Proteomics - Jena University Hospital)

来自于Jena大学医学院的Florian Meier教授介绍了基于BOXCAR DIA和diaPASEF技术的最新进展，对进一步推动深度蛋白质组覆盖和高定量准确性带来了有效策略。

ASMS 2020 Biognosys讲座第二场

1）DIA实现血浆外泌体蛋白质组深度覆盖，助力外泌体生物标志物筛选研究

“Data-independent Acquisition Strategies to Gain Deep Coverage into Human Plasma Exosomes for Biomarker Research”

Prof. Dr. Birgit Schilling (The Buck Institute for Research on Aging)

外泌体促进了各种细胞间的通信，因此在从癌症到衰老的细胞信号传导中具有显着多样的含义，血浆外泌体具有作为生物标志物的巨大潜力。然而，由于可溶性血浆蛋白的污染，从血浆中分离出高质量外泌体一直具有挑战性。

来自Buck研究所的Birgit Schilling教授介绍了DIA技术检测血液外泌体来寻找生物标志物的经验，Birgit教授开发了一种高通量方法（顺序尺寸排阻色谱法和超滤）从人血浆中分离外泌体，随后利用DIA方法，在单针DIA检测中定量超过1208个外泌体蛋白，为进一步的标志物研究打下坚实基础。

2）DIA技术优化：BOXCAR DIA和diaPASEF技术

“Quantifying the Expression and Turnover Control of Proteoforms”

Prof. Dr. Yansheng Liu (Yale University - School of Medicine)

Proteoform，表示可以发现单个基因的蛋白质产物不同分子形式，包括由于遗传变异，替代剪接的RNA转录本和翻译后修饰引起的变化。

来自耶鲁大学的刘延盛教授带来了Proteoform表达定量和动态变化控制的研究进展，通过结合DIA，pSILAC和对蛋白动态变化速度和表达量的全基因组范围的分析，进一步探讨了两种Proteoform：蛋白isoform的可变剪切和位点特异的磷酸化情况，并揭示它们在非整倍性上的遗传和非遗传定量决定因素。