你一直心心念念的如何挖掘植物抗逆基因，在这里

这两天小编我看了一篇植物蛋白质组学和代谢组学联合应用于挖掘植物抗逆基因的综述性文章，虽然是2013年的，但仍不失为一篇上乘之作，想着应该赶紧与大家分享一下，应该可以为您的研究带来一点点的启发。

文献来源

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Metabolo-proteomcis todiscover plant biotic stress resistance genes. Trends Plant Sci. 2013; 18(9): 522-31. (IF:10.899，可13年的时候人家有13.479呢)

内容介绍

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现如今，蛋白质组学和代谢组学越来越多地运用于植物抗逆领域的研究，这两个组学研究技术的有效结合对于发掘新的植物抗逆基因是非常重要的。加拿大麦吉尔大学植物科学系教授Ajjamada C. Kushalappa在Trends in PlantScience杂质上发表一篇文章，其标题为“Metabolo-proteomics to discoverplant biotic stress resistance genes”，从这篇文章中我们发现，利用代谢蛋白质组学技术将会极大的帮助科研工作者发掘新的抗逆基因。

因为植物的不可移动性，植物在其一生的生长过程中会遇到各种生物和非生物的胁迫，所以植物就发展了非常精密的调控各种生物和非生物胁迫的机制。

对于科研和育种工作者来说，发掘植物的抗逆基因并对其抗逆机制进行深入研究是非常重要的，而植物抗逆多是多基因调控的，所以基于表型学和代谢组学的正向遗传学比基于基因改造的反向遗传学更适合发掘新的植物抗逆基因（下图）。

（点击图片更清楚）

OMICs of plant resistance to biotic stress. Discovery of resistance genes, starting from metabolome or phenome is forward genetics, and the elucidation of biological mechanisms, controlled by a resistance gene is reverse genetics. Resistance-related metabolites and proteins, produced either constitutively or induced following biotic stress, are biosynthesized by the plant genome.

由于基于质谱的蛋白质组学和代谢组学技术近几年得到飞速发展，这两个组学技术的联合应用可以极大的帮助科研工作者挖掘多基因调控的主效抗逆基因。

本文建立了一种通过代谢蛋白质组学技术发掘植物抗逆基因的10步法工作流程（如下图）。此工作流程通过应用蛋白质组学技术和代谢组学技术，不仅可以发掘新的抗逆基因，而且可以对基因的抗逆机制进行深入研究，这对于把抗逆基因有效整合到高产作物品种中是非常重要的。

（点击图片更清楚）

Ten heuristic steps in metabolo-proteomics of plant biotic stress resistance. The ten heuristic steps involved in the application of metabolomics and proteomics technologies to decipher mechanisms of resistance and identify candidate genes in plants against biotic stress.

小编简单罗列出这十个步骤，你值得拥有

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Step 1. Selection of plant-pathogen systems

Selection of host genotypes

Selection of pathogen isolates

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Step 2. Enviroment influencing inoculation and infection

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Step 3. Assessment of quantitative resistance in plants against pathogen stress

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Step 4. Sample collection for biochemical analysis

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Step 5. Extraction and sample preparation for biochemical analysis

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Step 6. Mass spectrometry-based metabolomics and proteomics

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Step 7. Mass spectral output processing and compound annotation

Metabolite identification

Protein identification

Quantification of metabolites and proteins

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Step 8. Information extraction - the discovery of RR metabolites, proteins, and genes

Identification of R proteins and RR biochemicals

Mapping RR metabolites in metabolic pathways and searching proteins in genomic databases to identify R or RR genes

Validating the R or RR gene resistance function

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Step 9. New knowledge generation - mechanisms of resistance in plants to biotic stress

Signaling molecules

Antimicrobial biochemicals and resistance equivalence

Cell wall enforcement

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Step 10. Knowledge application and technology transfer

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