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iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组学

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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

iTRAQ技术是由美国应用生物系统公司(Applied Biosystems IncorporationABI)研发的一种多肽体外标记技术。该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量

技术原理

iTRAQ试剂由报告基团、中性平衡基团和肽反应基团三部分组成(如图1),其中反应基团可以同肽段N末端和赖氨酸ε氨基基团发生反应,标记生物样品中产生的所有肽段平衡基团(31-24Da)用来平衡分子量,保证与每一种报告基团(113-121Da)结合后总的相对分子质量都是145。在质谱分离过程中,不同样本中同一多肽表现为相同的质荷比;经过二级质谱时,平衡基团发生中性丢失,而报告基团在二级质谱低质量区域产生不同报告离子,根据报告离子的信号强度值可获得蛋白质的定量信息。


实验流程


检测仪器

Thermo Scientific Q Exactive

 

技术特点

1. 液质联用,分离能力强、分析范围广,组织或细胞中可鉴定多达6000种蛋白;

2. 可同时对2-8个样本进行差异蛋白分析;

3. 适合广泛样品类型:胞浆蛋白、膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白等;

4. 可检测出低丰度蛋白、强碱性蛋白、小于10KD或大于200KD的蛋白、难溶性蛋白等。

样本要求

样本类型

样本要求

蛋白质提取液

浓度达1μg/μl,总蛋白量达300μg

 

细胞样本

细胞量达107

组织样本

动物、微生物组织湿重10mg;植物鲜嫩组织100mg

 

体液样本

血液体积大于500μl

 

代表性文献

1. Rebekka K S, et al. Rps14 haploinsufficiency causes a block in erythroid differentiation mediated by S100A8 and S100A9. Nat Med, 2016; 22: 288-297.

2. Kim M S, et al. A draft map of the human proteome. Nature,2014;509(7502): 575-581.

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