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蛋白质非标记定量技术(label-free)是直接通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
技术原理
运用DeCyder MSTM软件,领先的蛋白质组学定性定量算法MaxQuant,对液相色谱串联质谱数据非标记定量分析是将质谱数据由谱峰形式转化为直观的类似双向凝胶的图谱,谱图上每一个点代表一个肽段,而不是蛋白质;再比较的不同样本上相应肽段的强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
实验流程
检测仪器
Thermo Scientific Q Exactive
技术优势
1. 对LC-MS的稳定性和重复性要求较高;
2. 不受样本条件限制,可进行大批量样本的检测;
3. 无需昂贵的同位素标签做内标,实验费用低;
4. 对于低丰度蛋白的检测效率较高。
样本要求
样本类型 | 样本要求 |
蛋白质提取液 | 浓度达1μg/μl,总蛋白量达300μg
|
细胞样本 | 细胞量达107 |
组织样本 | 动物、微生物组织湿重达10mg;植物鲜嫩组织达100mg
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体液样本 | 血液体积大于500μl |
代表性文献
1. Dislich B, et al. Lable-free quantitative proteomics of mouse cerebrospinal fluid detects BACE1 protease substrates in vivo. Mol Cel Proteomics,2015;14(10).
Cholewa B D, et al. Large-scale label-free comparative proteomics analysis of polo-like kinase 1 inhibition via the small-molecule inhibitor BI 6727(Volasertib) in BRAFV60E mutant melanoma cells. J Proteome Res,2014;13(11):5041-5050.
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