在蛋白质组学临床研究中使用SONAR和Biognosys PQ500 对血浆蛋白质进行快速定性分析和绝对定量

蛋白质组学定量分析通常使用稳定标记同位素(SIL)进行绝对定量。最新的技术 进展是肽试剂盒，采用该方法可对血浆样品组中的500多种蛋白质进行定量分析。 然而，如果使用传统MS采集模式(例如多反应监测(MRM))采集数据，会面临 技术方面的挑战，因为仪器的负载循环会受到影响，进而导致数据采样不足。 另一种方法是SONAR，这是一种数据非依赖型分析(DIA)方法，既能实现高通 量分析，又能确保高特异性，而且可以保持定量性能。已有文献对SONAR进 行了介绍1,2，其重点是如何利用快速扫描四极杆技术将SONAR整合到快速的 色谱分析和高通量的工作流程中。涉及蛋白质组学分析的临床研究就是高通量 分析的一个实例，在分析过程中需要借助SONAR带来的分析优势。本应用纪 要介绍了SONAR的一个应用实例，在本应用中，我们使用SONAR对人类样品 (包括对照样品、慢性阻塞性肺病(COPD)患者样品和哮喘患者样品)中的血浆 蛋白质进行了高通量的绝对定量分析。