转录组测序（RNA-seq）

转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点，利用Illumina大规模测定mRNA序列获得转录本信息，该技术具有通量高、覆盖范围广、精度高等特点。其不依赖于基因组参考序列，使所有生物都可以成为研究对象，同时能够在全基因组范围内检测真核细胞中广泛存在的可变剪切现象，为转录本的结构研究、基因转录水平研究、全新转录区域研究等提供重要的研究工具。通过Illumina新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本及基因序列，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

技术路线：

分析流程：

结果案例：

无参考基因组RNA-seq分析

Trinity拼接Contig长度分布

韦恩图

GO功能分布图

COG功能分布图

有参考基因组RNA-seq分析

                           两两样本之间表达量的分布图，较对角线离散意味着表达差异越大

                                          样本差异基因表达量的聚类图

                                                            样本表达分布

                                                            表达模式聚类图

服务说明：

样品浓度≥200ng/ul，OD_260/280为1.8-2.2，总RNA含量≥20ug（qibit检测为准），干冰运输

参考文献：

1、Fan H, et al. Deep Sequencing-Based Transcriptome Profiling Reveals Comprehensive Insights

 into the Responses ofNicotiana benthamiana to Beet necrotic yellow vein virus Infections 

Containing or Lacking RNA4. PLoS One. 2014;9(1):e85284.

2、Wang XC, et al. Global transcriptome profiles of Camellia sinensis during cold acclimation. BMC Genomics. 2013;14:415.

3、Zhai R, et al. Transcriptome analysis of rice root heterosis by RNA-Seq.BMC Genomics. 2013;14:19.

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