App NGS-05 转录组测序


转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括 mRNA和非编码RNA 。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点，通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。  

随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展，RNA测序(RNA-Seq)已成为基因表达和转录调控机制研究领域的重要手段。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组研究是基因功能及结构研究的基础；通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。本公司采用优化去核糖体建库策略可以将核糖体残留率降低至~0.035%，可以获得高质量转录组测序数据,保证后续数据分析的准确率和成本控制。同时，针对新物种转录组的组装拼接和进化分析，本公司具有诸多解决方案可供选择；深入个性化分析助力您的科研进程。 

研究应用

• 有参考基因组转录组测序
• 无参考基因组转录组测序
• 真核转录组测序
• 原核转录组测序
• 链特异性测序
• 均一化文库测序

我们的优势

• 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠。
• 拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。
• 技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
• 拥有专业的生物信息团队和超算服务器，可为合作伙伴提供全面生物信息分析服务与技术支持。

• 测序技术服务流程

一、样品要求 

常规转录组测序  （原核）

样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。

样品需求量（单次）：原核生物样品：≥5μg。

样品浓度：原核生物样品：≥65 ng/μL。

样品纯度：原核生物样品：OD260/280≥1.8；OD260/230 ≥1.8；RIN ≥6.0，23S:16S≥1.0。

TruSeq微量转录组 （原核）

样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。

样品需求量（一次建库量）：≥1μg。

样品浓度：≥20ng/μL。

常规转录组测序  （真核）

样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。

样品需求量（单次）：植物和真菌样品：≥20 μg；人、大鼠、小鼠样品：≥5 μg；其他类型动物：≥10 μg；

样品浓度：植物和真菌样品：≥250 ng/μL；人、大鼠、小鼠样品：≥65 ng/μL；其它类型动物样品：≥150 ng/μL；

样品纯度：真核：OD260/280 =1.8～2.2；OD260/230 ≥2.0；动物样品：RIN ≥ 7.0，植物样品：RIN ≥6.5，28S:18S ≥1.0；昆虫样本无此指标；

TruSeq微量转录组 （真核）

样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。

样品需求量（一次建库量）：人、大鼠、小鼠样品：≥200ng；其他物种：≥1μg。

样品浓度：人、大鼠、小鼠样品：≥5ng/μL；其他物种：≥20ng/μL。

样品纯度：动物样品（昆虫除外）：RIN≥7.0；28s/18s≥1.0；植物、真菌：RIN≥6.5；28s/18s≥1.0。

二、项目运转周期

标准流程的运转周期约为50个工作日。

三、项目合格指标

产生不低于合同规定的clean reads数。 


更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/products/transcriptome/rnaseq/

 

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• 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计 完成近万个样本的测序与分析服务
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