您好,欢迎您查看分析测试百科网,请问有什么帮助您的?

稍后再说 立即咨询
上海惠研生物科技有限公司
400-6699-117转1000
热门搜索:
分析测试百科网 > 惠研生物 > 生物信息学 > DCAM-06:基于甲基化谱构建疾病预后诊断预测模型

DCAM-06:基于甲基化谱构建疾病预后诊断预测模型

非会员

诚信认证:

工商注册信息已核实!
扫一扫即可访问手机版展台
参考报价: 面议 型号: 暂无
品牌: 暂无 产地: 暂无
关注度: 148 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
咨询留言 在线咨询

400-6699-1171000

AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

 DCAM-06:基于甲基化谱构建疾病预后诊断预测模型
 
本方案可提供解决发现差异化DNA甲基化趋势的算法和计算分析技术,并依据差异化DNA甲基化谱构建疾病或表型的分类模型;特别的,对于病例对照设计实验的样本,我们可以构建用于临床预后或诊断的DNA甲基化分子预测模型。DNA甲基化的变异存在多种形式,各种形式的变异情况可能会导致疾病和其他个体表型的差异性。图-1给出目前通常被考虑到的DNA甲基化变异的类型。出现DNA甲基化变异的位点称为MVP: (Methylation variable position ),差异DNA甲基化区域称为DMR(Differentially methylated region),其中DMR可以发生于不同的情况下,例如:
 
• iDMR — imprinting-specific differentially methylated region
• tDMR — tissue-specific differentially methylated region
• rDMR — reprogramming-specific differentially methylated region
• cDMR — cancer-specific differentially methylated region
• aDMR — ageing-specific differentially methylated region.
 


 
 


特异等位基因甲基化位点和区域存在甲基化变异称为ASM(Allele-specific methylation),主要来自父母DNA甲基化模式的变异,并与SNP多态性相关联。特异单倍型的甲基化变异(Haplotype-specific methylation ,HSM)则指具有共同遗传的SNP特征的差异化甲基化区域。另外,针对CpG岛(CGI)特征区域所定义的甲基化变异也将会被分析考虑;除了CGI区域,在CGI外沿的低密度CpG位点区域,称为CGI shore, 也可能出现较大的甲基化程度变异。综上所述,本方案将考虑多方面的甲基化变异情况采用SVM支持向量机理论中的多项式核算法技术加以识别和判断。
 
在本项目中我们采用简易和较为稳定的多项式分类器和SVM优化算法SMO[19-20]构建疾病特征预测模型。 由于统计学习理论和支持向量机建立了一套较好的有限样本下机器学习的理论框架和通用方法, 既有严格的理论基础, 又能较好地解决小样本、非线性、高维数和局部极小点等实际问题, 因此成为生物学领域的研究方向之一, 其核心思想就是学习机器要与有限的训练样本相适应,得到鲁能性的疾病诊断预测模型。
 
 


 疾病预测模型分析结果与讨论

 
 
 疾病模型的准确度评估(Summary Table-1)

 
 
 
 

图-3.甲基化差异趋势结合生存随访数据进行生存分析

 

更多详情:http://www.biogenius.cn/htm/solution/Biochip/78.html

 

 

Big Data , Big Idea !    
惠研生物,提供领先的生物大数据解决方案!

 

  • 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计 完成近万个样本的测序与分析服务
  • 累计协助客户发表权威SCI论文总IF超过 160分
  • 512核心CPU,1T内存 满足大规模并行的,敏捷的数据分析服务;
  • 1PB 数据磁盘阵列保证企业级 测序分析结果存储的安全稳定
 

官方网站:www.biogenius.cn 
咨询热线:400-016-9606 / 180-1908-2932
 
官方微信: 微信公众平台搜索 “惠研生物”  
官方QQ: 1744353207 
咨询邮箱: service@biogenius.cn

DCAM-06:基于甲基化谱构建疾病预后诊断预测模型信息由上海惠研生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于DCAM-06:基于甲基化谱构建疾病预后诊断预测模型报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

DCAM-06:基于甲基化谱构建疾病预后诊断预测模型 - 产品推荐
移动版: 资讯 直播 仪器谱

Copyright ©2007-2024 ANTPEDIA, All Rights Reserved

京ICP备07018254号 京公网安备1101085018 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号