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App Chip-07 DNA甲基化芯片解决方案

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App Chip-07 DNA甲基化芯片解决方案

 

高密度的升级版 Human 450K 甲基化芯片实验服务与配套下游综合数据分析服务将围绕DNA甲基化组进行系统的生物学问题的探索。

表观遗传学标记(Epigenetic marks)是由酶介导的DNA和相关染色质蛋白的生物化学修饰。尽管表观遗传标记不能改变DNA序列,但他们包含着遗传讯息并在调控基因组功能中发挥重要的作用。这类标记包括:胞核嘧***甲基化(cytosine methylation),组蛋白尾端和组蛋白核心的转录后修饰,以及核小体定位(nucleosomes positions)。他们影响着转录状态和染色质的其他重要功能,例如:DNA甲基化和某些组蛋白H3 N端尾端的残基对转录基因的沉默和异染色质的形成起到关键性作用。这些标记针对具有细胞毒害作用的非编码基因序列的沉默,包括转座子(transposons),假基因(pseudogens),重复序列(repetitive sequences),以及整合的病毒而言就会被激活。表观遗传上的基因沉默在发育现象中,包括植物和动物中的印记基因现象,以及在细胞分化和重编程过程都中发挥重要的作用。 

 

 

  

 

研究内容

 

DCAM-01:DNA甲基化芯片原始数据的预处理

DCAM -02:DNA甲基化芯片相关性与重现率(重复率/相关性)分析

DCAM -03:DNA甲基化芯片的处理组-对照组相关性评估

DCAM -04:甲基化/非甲基化位点(基因)Fisher和Pearson卡方统计检验

DCAM -05:样本组间的甲基化趋势差异分析

DCAM -06:样本组间的甲基化趋势(非监督/监督式)聚类分析

DCAM -07:基于甲基化谱构建疾病预后、诊断预测模型

DCAM -08:差异化甲基化位点临近基因生物通路分析

DCAM -09:差异化甲基化位点临近基因生物学功能注释

DCAM -10:DNA甲基化趋势与基因表达调控的关联分析

DCAM -11:DNA甲基化差异位点邻近启动子区调控基序(motif)的识别

DCAM -12:DNA甲基化趋势在TSS邻近区域的分布特征

DCAM -13:DNA甲基化趋势在基因组染色体上的分布特征

DCAM -14:MeDIP芯片技术与甲基化综合数据分析
 

 


更多详情:http://www.biogenius.cn/htm/solution/Biochip/78.html

 

 

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  • 全基因组测序/外显子组, 转录组等项目共计 完成近万个样本的测序与分析服务
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