App MG-04 构建微生物共相关网络

App MG-04 构建微生物共相关网络

根据微生物基因组的beta多样性，将微生物之间的关系以网络形式进行展示，通过种群之间共享ORF的数目及其功能相对丰度进行PCC（相关性）计算，权重作为网络边的权重，网络节点为微生物群落内的成员，zei后建立微生物共相关网络。本方案也将对微生物网络的拓扑学结构进行深度解析：包括度与边，节点分布规律和权重大的发挥重要的微生物种群的定位。 

 

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宏基因组（Metagenome） 

宏基因组（Metagenome）也称微生物环境基因组(Microbial Environmental Genome), 或元基因组。宏基因组学 (或元基因组学, metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段, 以微生物多样性、 种群结构、 进化关系、 功能活性、 相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。一般包括从环境样品中提取基因组 DNA, 进行高通量测序分析，或克隆DNA到合适的载体,导入宿主菌体,筛选目的转化子等工作。

特定生物种基因组研究使人们的认识单元实现了从单一基因到基因集合的转变，宏基因组研究将使人们摆脱物种界限，揭示更高更复杂层次上的生命运动规律。在目前基于大规模高通量测序技术发展的基础上，细菌宏基因组，甚至病毒宏基因组已成为研究和开发的主要对象。

系统学分析使研究者可以更有效地开发细菌基因资源，更深入地洞察细菌多样性。如环境宏基因组成为生物催化剂的新来源，而人体肠道宏基因组使得人类认识到疾病与宏基因组的相互作用关系和宿主受到宏基因组的病理性影响，研究者可开发靶向性的治疗方案。 
 

更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/solution/BigData/metagenome/68.html

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