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简介
RRBS测序 RRBS 由于经过了Bisulfite 处理,凭借着其单碱基分辨率,能够精确评估覆盖区域的甲基化水平。再加上酶切打断的原理,该方法的覆盖范围具有良好的重复性和稳定性;并且能通过酶切位点过滤部分降解片段对结果的影响。但是RRBS 的覆盖范围被酶切位点所限制,只能覆盖基因组的部分区域,主要集中在promoter 和CpG island 等富含CpG 的区域。在疾病研究中,Promoter 的甲基化状态与基因表达、性状表型息息相关,RRBS 作为一种关注CpG-rich 区域的甲基化研究方法,能够避免过多的数据浪费,更有针对性的研究覆盖区域的甲基化状态,使得大样本量单碱基分辨率的甲基化差异研究成为可能。综上所述:RRBS 作为一种高性价比的甲基化研究方法,在大规模的临床样本的研究中具有广泛的应用前景。
应用领域 大样本单碱基分辨率甲基化差异分析 疾病分子标记开发
分析内容
1. 标准信息分析
a)去接头污染,去低质量reads 和产量情况统计
b)RRBS 序列与参考序列的比对(基于1)
c)Promoter 和CpG 岛(CGI)覆盖度分析(基于1,2)
d)Promoter 和CGI 区的甲基化分析(基于1,2)
e)差异性甲基化区域(DMR)分析(基于1,2)
2. 高级信息分析 结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容 样品要求
样品类型:
DNA 样品; 样品需求量:总量≥ 3μg,浓度≥50ng/μL; 样品完整性:DNA 无明显降解与蛋白污染,需提供凝胶电泳检测胶图
项目周期 :单个样品标准流程的运转周期约为45 个工作日
RRBS测序信息由广州基迪奥生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于RRBS测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途