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简介
MeDIP-seq:利用MeDIP技术富集甲基化的DNA片段,再利用大规模测序技术测序。研究者可以较小的数据量,快速高通量地发现靶基因组上的甲基化区域。应用领域:DNA甲基化研究; 比较不同细胞、组织、疾病样本间的DNA甲基化修饰模式的差异;DMRs(甲基化差异区域)的研究。
应用领域
样本间DNA甲基化修饰差异分析
大样本量疾病研究
比较不同细胞、组织、疾病样本间的DNA甲基化修饰模式的差异;
DMRs(甲基化差异区域)的研究。
分析内容
1. 标准信息分析
对测序结果进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估
2. 高级信息分析
a)MeDIP-seq序列与参考序列的对比
b)MeDIP-seq序列数据在全基因的分布趋势
c)统计MeDIP-seq序列富集区域(peak)的信息
d)基于Peak的多样品间差异分析
e)可结合客户的需求,协商确定个性化信息分析内容 样品要求 样品需求量:总量≥5μg,浓度≥50ng/μL; 样品完整性:DNA无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图
项目周期
完成时间:单个样品标准流程(上图)的运转周期约为50个工作日。遇样品数较多时,项目周期根据项目规模而定。 完成标准:产生不少于合同的clean data
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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途