CHIP测序

简介

CHIP测序 染色质免疫共沉淀测序（ChIP-Seq）是指对染色质免疫共沉淀（ChIP）即使用抗体中和特定的蛋白，富集特异***联的DNA-蛋白质复合体，然后将寡核苷酸接头与特异性蛋白结合的DNA延伸拼接，进而对染色质免疫共沉淀获得的微量DNA片断进行海量平行测序。 CHIP测序与低分辨率的Chip芯片技术不同，ChIP-Seq经一次测序就准确的进行全基因组的关联分析，实现了全基因组范围内更精确、更敏感、更经济的定位目标蛋白所有的结合位点。可以解决芯片固定数量的阵列特征或候选序列的问题，自由阐释结合事件。

应用领域 判断DNA链的某一特定位置组蛋白修饰的类型 精确定位RNA polymerase II及其它反式因子在基因组上结合位点 组蛋白共价修饰与基因表达的关系的研究 转录因子结合位点和功能研究

分析内容

1. 标准信息分析

对测序结果进行图像识别（Base calling），去除污染及接头序列；统计结果包括：测定的序列（Reads）长度、 Reads 数量、数据产量

2. 高级信息分析

    a)ChIP-Seq 序列与参考序列比对；

    b)Peak calling ：统计样品 Peak 信息（峰检测及计数、平均峰长度、峰长中位数）；

    c)统计样品 Uniquely mapped reads 在基因上、基因间区的分布情况及覆盖深度；

    d) 给出每个样品 Peak 关联基因列表及 GO 功能注释；

    e)对序列进行Motif分析； f)在多个样品间，对Peak进行差异分析；

    g)在多个样品间，对与 Peak 关联基因做差异分析； 样品要求 DNA样品需求量：总量≥ 10 ng 注：请提供DNA打断时的检测胶图，要求打断后的DNA电泳主带在100-500bp范围内，建议在250bp左右。

项目周期

若客户提供的是细胞系样品，标准流程的完成时间约为45个工作日； 若客户提供的是免疫沉淀后的DNA样品，标准流程完成时间约为30个工作日；

CHIP测序信息由广州基迪奥生物科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于CHIP测序报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途