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细菌基因组测序
服务简介
随着新一代测序技术的迅猛发展,全基因组测序已经成为细菌基因组研究不可或缺的重要工具。下一代高通量测序技术大大降低了细菌基因组研究的成本,缩短了研究周期,为越来越多的实验室提供了细菌基因组研究的便利。吐露港生物科技采用PacBio平台结合Illumina测序平台,可以提供高效、快速、廉价的细菌基因组完成图。
服务类型
根据不同的研究目的和需求,吐露港提供以下3类服务供选择:
(1)细菌精细图:采用大片段加小片段建库,然后利用Illumina HiSeq2500深度测序和初步的基因组组装策略,性价比高,满足细菌基因组研究基本需求。
(2)细菌完成图:综合利用PacBio RSII(第三代单分子实时荧光测序技术)结合Illumina HiSeq2500深度测序,根据菌株具体情况制定zei优策略,zei终得到一条完整的基因组序列(补齐所有的gaps)。
(3)细菌重测序:针对已知基因组序列的细菌,采用HiSeq深度测序,后续分析不依赖于组装,关注基因组变异情况(包括SNP和InDel等),是群体研究的首选。
服务流程
收费标准
测序项目 | 费用(RMB) | 周期(工作日) |
细菌精细图 | 1.6万(基因组< 5M);2.2万(基因组>5M) | 30 |
细菌完成图 | 3.0万(基因组< 5M);4.5万(基因组>5M) | 50 |
细菌重测序 | 0.2万/1M基因组 | 20 |
数据分析 | 费用(RMB) | 周期(工作日) |
1. 基因预测 | 150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
2. 功能注释 | 150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
3. COG分类 (默认COG数据) |
150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
4. 代谢通路构建 (默认KEGG数据库) |
150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
5. tRNA、rRNA预测 | 150(对于选择测序服务客户,免费) | 5 |
6. 基因组岛预测 (只针对完成图) |
200 | 5 |
7. 蛋白亚细胞定位 | 200 | 5 |
8. 比较基因组学分析 8.1 SNP分析 8.2 Indel分析 8.3 Pan-genome分析 8.4 基因组结构分析 (8.4只针对完成图) |
600 | 5 |
9. 次生代谢基因簇分析 (只针对完成图) |
400 | 5 |
10. 基因组圈图绘制 (只针对完成图) |
400 | 5 |
11. 进化树分析 (客户提供≥2个参考基因组链接) |
200 | 5 |
注明:
对于所有数据分析(单选或全部),均在5个工作日内完成。
微生物全基因组测序信息由上海吐露港生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于微生物全基因组测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途