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北京诺禾致源科技股份有限公司
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| 参考报价： | 面议 | 型号： | 细菌基因组测序 |
| 品牌： | 诺禾致源 | 产地： | 北京 |
| 关注度： | 77 | 信息完整度： |  |
| 样本： | 典型用户： | 暂无 |
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探究无限神奇的过去与未来
细菌基因组研究，是通过基因组测序和组装获得细菌全基因组序列，并对其进行结构和功能研究的方法。依据研究目标所需精细程度的不同，我们提供了细菌框架图、精细图和完成图三种不同的解决方案。通过对这些细菌测序研究，我们可以更好地了解和掌控菌株的生理过程，让细菌更好地为我们所用。
科学方案设计
从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。多平台的选择，不同精细程度的细菌基因组测序方案，适用不同研究背景，为您量身定制最适宜的细菌基因组解决方案。
| 产品 | 测序平台 | 测序策略 | 组装指标 | 适用范围 | 项目周期 |
| 细菌框架图 | Illumina PE150 | 350 bp文库 ≥ 100 X | 无 | 大规模测序 快速扫描 | 30个自然日 |
| 细菌精细图 | Illumina PE150 | 350 bp文库 ≥100X 6 Kbp文库 ≥100X | ≤30 scaffolds | 中等规模测序 适度精细 | 45个自然日 |
| 细菌完成图 | PacBio | 10 Kb SMRT 文库 ≥50 X | 1 contig 0 Gap | 少量菌株测序 精确到位 | 60个自然日 |
信息分析
分析内容=标准分析+高级分析。
不同精细程度的细菌基因组信息分析，解密细菌的发展历程，探究其潜在价值。
| 基因组组装 | 基因组组装及结果评估 | 组装获得高质量的基因组序列 |
| 基因组结构研究 | 编码/非编码基因预测 | 预测编码/非编码基因信息 |
| 重复序列分析 | 分析基因组重复序列结构 | |
| 基因岛预测 | 预测基因组内基因岛结构 | |
| 前噬菌体预测 | 预测基因组前噬菌体序列 | |
| CRISPR 预测 | 对基因组进行 CRISPR 预测 | |
| 基因基本功能注释 | 常见功能数据库注释 (NR、GO、COG、KEGG、SwissProt、Pfam、TCDB、CAZy) | 通过常见权威数据库解释编码基因功能 |
| 全基因组功能圈图展示（精细图/完成图） | 全面总览基因组组分情况 | |
| 基因组甲基化修饰分析（完成图） | 总览基因组甲基化修饰情况 | |
| 菌株致病相关研究 | 分泌系统效应蛋白、病原与宿主互作、分泌蛋白、次级代谢产物基因簇 | 从胞外分泌、宿主互作等机制解释菌株致病性 |
| 细菌致病菌毒力因子和耐药基因注释（VFDB、 ARDB、CARD ） | 毒力因子及致病性相关基因 |
深入到位的数据挖掘
不论是个体深入变异解析，还是群体进化历史解读，我们都有完备的解决方案，为您解决关心的生物学问题。
| 研究目标 | 应用技术 | 解决问题 |
| 个体深入变异解析 | 基因组间共线性分析 | 基因组一对一共线性比较寻找基因组间同源序列 |
| 基因组间变异检测 | 以共线性区域为基础全面解析基因组间变异信息 | |
| 群体进化历史解读 | Core-pan基因解析 | 构建Core-pan基因集合单拷贝基因用于进化分析 |
| 进化树构建、ANI、cgMLST | 构建菌株间进化关系解析菌株起源传播规律 |
悦读高质量测序数据，尽享HPC澎湃动力
细菌基因组测序采用先进的Illumina、PacBio测序平台，快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台（High Performance Computing，HPC）采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合，实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展，高性能计算平台将会持续更新并扩容，以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
出色完成每一个项目环节
诺禾致源微生物客户遍布全球，截止2017年12月，已发表20余篇微生物文章，细菌基因组完成样品数超过20000个，项目合作领域涵盖了动植物致病菌、工业菌、益生菌、环境菌株等广泛领域。
“科学的方案设计，严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，优质的项目服务”
确保每一个环节都能出色完成，助力科学研究。
细菌基因组测序信息由北京诺禾致源科技股份有限公司为您提供，如您想了解更多关于细菌基因组测序报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。
注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途
