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参考报价: | 面议 | 型号: | 16S/18S/ITS扩增子测序 |
品牌: | 诺禾致源 | 产地: | 北京 |
关注度: | 272 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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一步到位检测环境微生物多样性
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
ITS分为两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于5.8S和28S之间。
读长长, 周期短, 性价比高。
采用Ion S5 XL测序平台,以半导体测序技术为核心,直接将化学信号转换成数字信号,单端测序,无需拼接,平台重复性比Illumina测序平台更好,SE400/SE600两种模式,为扩增子测序提供更多的选择。
科学方案设计
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
信息分析
分析内容=标准分析+高级分析。
基于目标区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和群落结构差异性。
高级分析 | 解决问题 |
肠型分析 | 肠道菌准确定位和疾病预测和治疗 |
PICRUSt | 预测宏基因组的功能组成 |
FAPROTAX | 预测环境样本的生物化学循环过程 |
Tax4fun | 肠道、土壤等样品的功能预测 |
FunGuild | 预测真菌的生态功能 |
标准分析 | 解决问题 |
物种注释 | 物种注释及各物种丰度信息 |
α-多样性分析 | 微生物群落的丰富度和多样性 |
β-多样性分析 | 不同样本间的微生物群落 及各样本差异情况 |
多元统计分析 | 寻找组间具有显著差异的物种,同时可以比较组内差异和组间差异的大小,判断分组是否有意义 |
CCA分析 | 研究物种组成与环境因子间的关系 |
环境因子关联分析 | |
VPA分析 |
扩增子测序解密环境微生物多样性
诺禾致源基于多样性的测序区域选择,结合研究目的和样品自身的特点,灵活制定研究方案,用专业成熟的样本制备、建库以及数据分析流程,客观还原样品本身的菌群结构以及丰度。
悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力
扩增子测序采用先进的Ion S5 XL测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
项目经验丰富
至2017年12月,诺禾致源诺禾16S样本数突破220,000例,包括土壤、水体、粪便、淤泥、发酵物等样本。“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。
16S/18S/ITS扩增子测序信息由北京诺禾致源科技股份有限公司为您提供,如您想了解更多关于16S/18S/ITS扩增子测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途