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单细胞文献一周速递 | 厉害了!5篇SCI平均IF:29.86!

发布时间: 2020-01-22 12:01 来源:上海欧易生物医学科技有限公司

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人类青春期睾丸发育的动态转录细胞图谱

【发表期刊】Cell Stem Cell

【影响因子】 21.5

【发表时间】2020.01.09

【文献类别】细胞图谱-睾丸

【文章摘要】人类睾丸在青春期经历了剧烈的发育和结构变化,包括体细胞的增殖和成熟,以及精子形成的开始。为了描述这一未被研究的过程,研究人员分析了来自四个青春期男孩的大约10000个睾丸细胞的单细胞转录组,并将其与婴儿和成人进行了比较。在青春期,未分化的精原细胞在配子发生之前就已经开始扩增和分化。值得注意的是,研究人员鉴定了睾丸间质和肌样细胞的共同的青春期前祖细胞,并描述了控制青春期分化的念珠菌因子。此外,发育期前的睾丸支持细胞在转化为另一个青春期的单一成熟群体之前,在代谢谱上表现出两种不同的转录状态。睾丸激素在支持细胞成熟、抗菌肽分泌和精原细胞分化中的作用通过睾丸激素抑制的转雌睾丸的单细胞分析得到进一步强调。总之,人类睾丸发育转录图谱为男性青春期发育变化和关键因素提供了多种见解。

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体感神经元的转录特征

【发表期刊】Nature

【影响因子】 43.1

【发表时间】2020.01.08

【文献类别】细胞图谱-体感神经元

【文章摘要】超过12种在形态和生理上截然不同的初级躯体感觉神经元亚型描述了人类内外环境的显著特征。目前还不清楚在发育过程中如何出现专门的基因表达机制来赋予这些亚型独特的特性。为了评估每个主要体感神经元亚型转录成熟的发育过程,研究人员制作了一个覆盖小鼠主要体感神经元谱系的细胞转录组图谱。本文中,研究人员证明了体感神经发生导致神经元处于转录非特化状态,其特征是转录因子的共同表达,随着发育的进行,这些转录因子被限制在选择亚型上。对缺乏转录因子的突变小鼠感觉神经元的单细胞转录组分析表明,这些从广泛到受限的转录因子协调了维持其表达亚型特异性基因表达机制。研究人员还发现神经元靶点也参与了这一过程;原型靶源性神经营养因子NGF的破坏导致转录因子表达异常亚型限制性模式。研究人员的发现支持了一个模型,在这个模型中,从中间和最终靶区发出的信号通过调节受亚型限制的转录因子的选择,将细胞从转录非特化状态过渡到转录独特的亚型,从而促进神经元的多样化。

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单细胞重建成人衰竭和恢复期心脏揭示了潜在的细胞功能图谱

【发表期刊】Nature Cell Biology

【影响因子】 17.7

【发表时间】2020.01.08

【文献类别】细胞图谱-心脏

【文章摘要】由于心脏病的患病率和高死亡率,有必要对人类心脏进行更详细的描述;然而,这在很大程度上受到心脏组织细胞多样性和样本获取受限的阻碍。本文中,研究人员展示了21422个单细胞的转录组谱——包括心肌细胞(CMs)和非CMs (NCMs)——来自正常、失败和部分恢复(左心室辅助装置治疗)的成人心脏。房室细胞对比分析显示,房室间和房室内CM存在明显的异质性,而NCM细胞类型作为主要的细胞通讯中枢在房室间具有特异性。对细胞组成和细胞-细胞相互作用网络的系统分析表明,心肌细胞收缩力和代谢是与心功能变化相关的最突出的方面。研究人员还发现了NCMs在调节CMs行为方面的积极参与,以ACKR1+-内皮细胞为例,注射该细胞可在损伤后维持心功能。除了作为一个丰富的资源,本文的研究结果还为心脏疾病的细胞类型靶向干预提供了见解。

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对构象特异性KRAS(G12C)抑制的快速非均匀适应

【发表期刊】Nature

【影响因子】 43.1

【发表时间】2020.01.08

【文献类别】癌症研究-肺癌

【文章摘要】KRAS GTP激酶在三分之一的癌症中被激活,而KRAS(G12C)是肺腺癌中最常见的激活改变之一。KRAS(G12C)抑制剂处于I期临床试验,早期数据显示近一半的肺癌患者有部分反应。癌症细胞如何绕过抑制来阻止对治疗的最大反应仍不清楚。由于KRAS(G12C)在活性构象和非活性构象之间循环,而抑制剂仅与后者结合,研究人员通过研究单细胞分辨率处理的效果来测试同基因细胞群是否以非均匀的方式反应。本文中,研究人员发现,治疗后不久,一些癌细胞被隔离在一个低KRAS活性的静止状态,而其他绕过这一影响,恢复增殖。这种快速的扩张型反应的发生是因为一些静默细胞产生新的KRAS(G12C)来响应抑制分裂素激活蛋白激酶的输出。新的KRAS(G12C)通过表皮生长因子受体和aurora激酶信号传递维持其活性和药物不敏感状态。没有这些适应性变化的细胞——或这些变化在药理学上受到抑制的细胞——对药物治疗仍然敏感,因为新的KRAS(G12C)要么不可用,要么处于非活性的药物敏感状态。KRAS癌蛋白的直接靶向是精准肿瘤学的一个长期目标。本文的研究揭示了一种灵活的非均匀适应机制,使群体中的细胞群能够快速绕过治疗的影响。如果人们要在临床中获得完整和持久的反应,就必须克服这种适应性过程。

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序号:2020-017

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一种整合基因表达图谱分析方法来确定肺肿瘤内皮细胞异质性和血管生成的候选方案

【发表期刊】Cancer Cell

【影响因子】 23.9

【发表时间】2020.01.13

【文献类别】癌症研究-肺肿瘤

【文章摘要】患者、物种(人/小鼠)和模型(体内/体外)之间肺肿瘤内皮细胞(TEC)表型的异质性在单细胞水平上的研究仍然很少。研究人员用单细胞RNA (scRNA)测序了来自人/小鼠(周围)肿瘤肺和人工培养的人肺的56,771个内皮细胞,并检测了17种已知的和16种以前未被识别的表型,包括推定调节免疫监视的TECs。研究人员将典型的顶端TECs分解为已知的迁移端和推定的基底膜重构破坏表型。顶端TEC信号与患者生存期相关,而顶端/反面 TECs对血管内皮生长因子阻断最敏感。只有顶端TECs在物种/模型和共享的保守标记上是一致的。通过对不同人类肿瘤的scRNA序列数据、正交多组学和Meta分析数据的综合分析,并通过功能分析验证,确定胶原修饰是一种候选的血管生成途径。

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