一文看完欧易生物客户 2018 年 SCI 文章

欧易生物的项目文章我们进行了分月汇总，现在一年过去了，再就全年的项目文章进行一次总览。

2018 年，欧易生物用户可谓是成果丰硕，共发表 SCI 文章 196 篇，平均 IF 4.113。

按照文章影响因子来看：IF > 10 共6 篇，其中最高为 21.506 (Nature Immunology)；7 ≤ IF < 10 共 6 篇；5 ≤ IF < 7 共 27 篇；3 ≤ IF < 5 共 88 篇；IF < 3 共 69 篇。

图 | 用户文章 IF 分布图

按照产品来看：RNA-seq 产品文章数量最多（49 篇）；文库产品平均 IF 最高（7.603）。

图 | 用户文章按产品统计图

按照月份来看：8 月份用户文章数量最多，为单月 27 篇 SCI。

图 | 用户文章按月份统计图

近 200 篇文章，涉及的领域和研究内容非常多样，无法一一列举，下边是小编从个人角度，精选的 10 篇典型成果，供各位老师参考。

01

文章为同济大学贾鑫明教授课题组与清华大学林欣课题组合作，报道了 CARD9 基因 S12N 变异是变态反应性支气管肺曲霉菌病（ABPA）的易感基因，并阐明了该变异基因介导 ABPA 发病的分子机制，为阐明天然免疫细胞在诱导过敏反应中的作用提供新的理论依据。

02

中南大学罗湘杭教授课题组，先利用基因芯片得到一系列发生变化的lncRNA，并利用体内实验证明了经过严格筛选的lncRNA Bmncr有着影响 BMSCs 分化方向的功能，之后进行了一系列严谨的功能实验挖掘出分子机制。此过程中不仅分析了基因表达水平的变化以及是否与功能有联系，还以 Fmod和 Bmncr 的距离为入手点，找到 lncRNA 在 3D 层面发挥作用的机制。文章不仅确定了 Bmncr 是衰老相关的成骨微环境改变及 BMSCs 谱系分化的关键调控因子，其较为严谨的思路也为之后类似的研究提供了一个比较好的模板。

03

扬州大学刘巧泉教授课题组，通过图位克隆筛选到一个与粒形相关的基因 GS9。GS9 无效突变体籽粒细长，而过表达 GS9 导致形成圆形籽粒。GS9 编码一种没有已知保守功能域的蛋白质，它通过改变细胞分裂来调节颗粒形状。GS9 和卵形家族蛋白 OsOFP14 和 OsOFP8 之间的相互作用受 OsGSK2 激酶（一种油菜素类固醇信号通路的关键调节因子）调节。遗传互作分析表明，GS9 的功能独立于其他已知籽粒大小基因。将 gs9 等位基因转入优质水稻品种可显着改善粒形和外观品质。

04

上海交通大学唐克轩教授课题组，研究阐明了茉莉酮酸激活 AaTCP14-AaORA 复合体，调控Qing蒿素合成的新机制。

文章通过酵母双杂交筛库发现，黄花蒿腺毛特异表达的 AaORA 能够与 AaTCP14 相互作用，共同结合并激活qing蒿素合成途径的两个关键基因双键还原酶 2 (DBR2) 和醛脱氢酶 1 (ALDH1) 的启动子。进一步，通过酵母三杂交、荧光素酶互补实验等技术发现，茉莉酮酸信号通路抑制子 AaJAZ8 通过与 AaTCP14 和 AaORA 互作，从而抑制 AaTCP14-AaORA 复合体对 DBR2 启动子的激活能力。相反，茉莉酮酸处理诱导的 AaJAZ8 降解，能够解除对 AaTCP14-AaORA 复合体的抑制，促进qing蒿素的合成。

05

免疫微环境对上皮性卵巢癌（Epithelial ovarian cancer, EOC）的发展具有重要作用。Treg/Th17细胞不平衡与系统性红斑狼疮、糖尿病、肿瘤等多种疾病有关。上海交通大学医学院汪希鹏教授课题组和林盈盈博士，研究发现 TAMs 能够产生外泌体作用于微环境中毗邻的细胞，基于 TAMs 细胞来源的外泌体 miRNA 芯片分析，发现 miR-29a-3p 和 miR-21-5p 高表达。将两种类型的 miRNA mimics 转染到 CD4+ T 细胞，发现其抑制 STAT3 的表达，并造成 Treg/Th17 失衡。结果表明，外泌体能够调节 TAMs 细胞和 T 细胞的相互作用，产生的免疫抑制性微环境能够促进 EOC 肿瘤细胞的生长和转移。分析 TAMs 细胞来源的外泌体及其相关 miRNA 能够为 EOC 新的治疗方法奠定基础。

06

FERONIA (FER) 是细胞膜表面受体蛋白激酶，作为 RALF1 多肽信号的受体，可通过胞外域与 RALF1 直接结合来感受 RALF1 信号刺激并将该信号传递至细胞内，驱动一系列下游反应，来控制细胞生长。湖南大学于峰教授课题组研究发现，通过与 RALF1 结合，FER 首先提高 ErbB3 结合蛋白 1 基因 （ErbB3-binding protein 1, EBP1） 的 mRNA 的转录本水平，并使得 EBP1 蛋白发生磷酸化和 EBP1 的细胞核内积累。EBP1 与先前鉴定的 RALF1 调控基因（如 CML38）结合，来调控这些基因的转录，响应 RALF1 信号转导，形成 RALF1-FER-EBP1 的反应轴线。

07

神经胶质瘤是最为常见、侵袭性最强的一种原发脑部肿瘤。在多数患者体内神经胶质瘤都呈现浸润性生长，难以被完全切除，导致其高致死率。苏州大学附属第一医院黄煜伦教授课题组，利用基因芯片发现，与正常组织相比，在肿瘤组织中NEAT1的表达显著上调，且其表达量同疾病进程呈正相关。随后通过 knockdown 实验证明，NEAT1 作为竞争性内源 RNA，通过与 SOX2 竞争性结合 miR-132，间接地促进 SOX2 的表达，进而促进了细胞的生长与转移。

08

工业区的土壤和水体极易受到有机碳的污染，多环芳烃类物质（PAHs）由于其稳定的化学结构，在土壤中降解周期长，是一种非常难处理的有机污染物。中科院南京土壤研究所周东美研究院课题组验证不同尺寸零价铁对于多环芳烃污染土壤的修复能力。通过修复时期内土壤微生物的16S rRNA高通量测序技术，评估上述体系对环境的影响。在传统化学方法处理土壤污染的基础上，结合生境中微生物的群落和种类变化，全面和立体的展示了土壤修复过程中土壤本身的变化以及生态环境所受的影响，为将来化学降解和生物降解相结合提供了前瞻性的报道和研究。

09

性别决定机制是一个层级调控的过程，在不同物种中呈现高度多样性。其中，家蚕作为鳞翅类模式昆虫，其性别决定为 ZW 型。中科院植物生理生态研究所谭安江研究员课题组，通过 piRNA 测序，研究表明家蚕 PIWI 蛋白 BmSiwi 与家蚕发育和性别逆转相关；蛋白甲基化转移酶 BmAsh2 参与 piRNA 信号通路，BmAsh2 缺失能引起卵巢发育阻滞和性别逆转；并通过进一步实验表明，BmAsh2 能与 BmSiwi 相互作用，参与家蚕性别决定。

10

南京师范大学连宾教授通过表达谱芯片，研究了枯草芽孢杆菌与茅台酒特征风味的相关性。这篇文章虽然研究内容相对比较简单，影响因子不太高（IF 4.019），但这个项目进行过程中碰到了很大的困难，其中最大的困难就是枯草芽孢杆菌的 RNA 较难抽提。为此，欧易生物秉承以客户为中心的宗旨，摸索测试了各种抽提方法，终于使得项目顺利完成。最终，也是有感于欧易这种务实的作风，连宾教授将欧易生物列为文章共同作者。

2018 年文章盘点至此，期待 2019 年欧易能给更多用户带来更为丰硕的研究成果。

最后，感谢各位老师的厚爱。

2019也请多多关照！