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SNP分型检测技术服务

参考报价: 面议 型号: SNP分型检测技术服务
品牌: 卓立生物 产地: 上海
关注度: 16 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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      SNP(single nucleotide polymophism),即单核苷酸多态,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。一般来说,一个SNP位点只有两种等位基因,因此又叫双等位基因。SNP在人基因组中的发生频率比较高,大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点,是继微卫星之后的第三代遗传标记。有些SNP位点还会影响基因的功能,从而导致生物性状改变甚至致病。 

        SNP研究包括SNP发现(discovery)、SNP验证(validation)以及SNP筛选(Screening or Scoring)。广泛用于群体遗传学研究(如生物的起源、进化及迁移等方面,将逐渐取代微卫星而成为新一代的分子生物学标记)。和疾病相关基因的研究,在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。SNP的分布不均匀,非转录序列中要多于转录序列,绝大多数位于蛋白的非编码区。虽然SNP不及RFLP和短串联重复序列STR标记变异程度高,但由于数量巨大,分布频密,因此就整体而言,其多态性要高得多。  

       为适应日益增长的SNP研究需求,和各类客户的不同需要,我们利用多套技术方案为不同客户提供量身定做的个性化服务。


1.直接测序法进行SNP分析
       在所有SNP的检测方法中,对待检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法,也是SNP分析的金标准。通常情况下,纯合型SNP位点的测序峰为单一峰型,而杂合型SNP位点的测序峰为套峰,因而很容易将其区分开来。通过直接测序方法进行SNP检测的检出率接近100%。
1) 技术流程:
      样品基因组DNA提取 — 根据不同的区域进行引物设计、合成 — 对所有样品进行基因扩增并纯化 — 测序 — 统计与分析
2) 样品要求:
血液样品:样品为EDTA抗凝或枸椽酸钠抗凝,样品量大于1ml,样品采集后于-20℃或-80℃保存;
组织样品:样品可以为新鲜组织(最好-80℃保存)、石蜡包埋组织或95%乙醇中固定的组织,组织量大于50µg 细胞、菌液等。
3)提供结果:
实验流程、电泳图、测序图谱、SNP基因型统计结果等。


2.Taqman探针法(定量PCR)
        客户根据实验要求挑选出SNPs后,提交给我们进行引物与探针设计与合成,整个过程大约需要2~3周。上述工作完成后,客户提供2ug的DNA样品,经确认样品质量合格我们即可进行实验,帮您轻松完成大量样品的检测与分析。
1)技术特点:
A、适合位点数量少,样本通量高的检测(每个位点需要合成两条探针,探针合成费用高);
B、应用ABI7900、ABI7500定量PCR仪进行定量检测;
C、操作简便,只需一步 PCR 反应,无须进行纯化和预处理,直接上机检测;
D、结果清晰,软件分析结果界面友好,标出了每个样本的基因型及荧光强度,非常直观;
E、可采用ABI合成的探针或国产探针。
2)样品要求:同测序法。
3)提供结果:实验流程、电泳图、定量PCR结果、统计分析结果等。


3.Beckman SNPstream UHT genotyping技术方案
         客户根据实验要求挑选出SNPs后,提交给我们进行设计与评价,整个过程大约需要2~4周。客户提供2ug的DNA样品,经确认样品质量合格我们即可进行实验,帮您轻松完成大量样品的检测与分析。
1)技术特点:
        采用BECKMAN独家专利技术(单碱基引物延伸技术),需要样品量低,速度快,可采用12重或48重PCR,进行多位点同时检测。转化率约80%,成功率约90%,准确率达99%。
2)实验流程:
序列比对 — 引物设计(12重或48重)— 引物合成 — DNA抽提和定量 — PCR — 纯化 — 单碱基延伸反应 — 杂交 — 扫描 — 分析
3)样品要求:同测序法。
4)提供结果:实验流程、DNA电泳图、统计分析结果等。


4.Illumina Goldengate 技术方案---中通量SNP检测
        客户根据实验要求挑选出SNPs后,我们将提交给Illumina公司进行评价,评分通过后,委托Illumina公司进行生产。整个评分、生产及到货过程大约需要3~4个月。芯片到货后,客户提供2ug的DNA/样品,经确认样品质量合格我们即可进行实验,实验结果经Illumina Beadstudio分析软件进行分析,帮您轻松完成大批量的SNP检测与分析。
1)技术特点:
        利用illumina公司独有的微珠芯片专利技术,高检出率,高成功率,高准确率,为目前最佳中高通量SNP分析解决方案,极强的性价比,平均下来单个反应费用低。格式为96位点/芯片,384位点/芯片,768位点/芯片,1536位点/芯片,芯片订货数量应为96的倍数。
2)实验流程:
SNP位点选择 — SNP位点评估 — 芯片制作(委托illumina公司、时间约3个月) — DNA抽提 — 片段化 — 芯片杂交 — 扫描 — 数据统计分析
3)样品要求:同测序法。
4)提供结果:实验流程、DNA电泳图、芯片杂交图、原始数据、标准化后的数据、统计分析结果等。


SNP分型检测技术服务信息由上海卓立生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于SNP分型检测技术服务报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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