您好,欢迎您查看分析测试百科网,请问有什么帮助您的?

稍后再说 立即咨询
上海云序生物科技有限公司
400-6699-117转1000
热门搜索:
分析测试百科网 > 云序生物 > 一代测序/传统测序 > 超微量RNA甲基化测序
超微量RNA甲基化测序
非会员

诚信认证:

工商注册信息已核实!
扫一扫即可访问手机版展台
参考报价: 面议 型号: 超微量RNA甲基化测序
品牌: 云序生物 产地: 上海
关注度: 27 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
供应商性质生产商产地类别国产
咨询留言 在线咨询

400-6699-1171000

技术简介 
云序生物超微量RNA甲基化测序(超微量MeRIP-seq)对免疫共沉淀和高通量测序步骤进行优化,克服常规抗体富集至少需要100μg总RNA的难题,最低仅需500ng总RNA既可实验。并适用于检测微量样本如血清、血浆和外泌体。 
技术优势 
适用范围广:可检测m6A修饰,同时可检测m5C和m1A修饰; 
适用分子广:mRNA,环状RNA,LncRNA,pri-miRNA和tRNA; 
适用样本类型多:血清、血浆、细胞、组织、外泌体、富集后的总RNA、石蜡切片,其他类型请电询; 
物种:人、大鼠、小鼠、猪、牛、兔、羊、狗等哺乳动物。 
云序生物超微量RNA甲基化测序服务列表 

 

 

云序生物(m6A)RNA甲基化测序流程 


云序优势 :
一站式服务: 
客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 
优化的实验流程: 
MeRIP的富集效率是决定数据质量的关键,云序生物MeRIP实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。 
严格的质控: 
云序生物对MeRIP实验的各个关键步骤进行严格的质控,全程监控实验质量,确保客户得到优质的数据。 
专业的生物信息学分析: 
云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。 
特异性高: 
通过抗体特异性富集发生甲基化修饰的RNA片段,以较低的成本实现转录组范围的RNA甲基化研究。

样品运输及保存: 
样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 
样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。 

数据分析 :
1.识别甲基化富集峰
通过高通量测序和生物信息分析,识别(p <10-5)甲基化富集的基因组区域。

 

        注:每个样品组做一个Input,以去除基因组背景,降低假阳性率

2. RNA甲基富集峰注释
通过生物信息分析利用最邻近基因对富集峰进行注释,并根据峰中点相对于已知基因的位置,将富集峰为启动子峰、上游峰、内含子峰、外显子峰、基因间峰。


3. RNA甲基化富集峰区域的在基因组中的分布 
根据注释信息,绘制富集峰在不同基因组特征上的比例图。 
          
 4. RNA甲基化位点Motif分析 
RNA上甲基化的位点,可能包含某种序列motif。RNA甲基化酶可能正是通过识别这些motif特异性进行甲基化修饰,从而完成转录后调控功能。我们成功识别了全基因组的RNA上的甲基化位点后,获取序列就能使用生物信息学的手段来搜索这些motif,从而揭示RNA甲基化修饰的机制。 


5. 差异RNA甲基化区域的识别与聚类 
云序生物使用 diffReps 软件进行差异甲基化位点的识别。默认筛选标准为 FDR<=0.05,具体以报告为准。 识别样本间的差异甲基化区,发现与特定表型或疾病相关的甲基化区域。 

6. 差异甲基化区的GO与信号通路分析
对差异甲基化基因进行功能分类,并发现显著性富集的功能条目。 

7. Reads 的分布
使用 ngs.plot 工具可以展示匹配 reads 在 TSS, genebody, TES 等位点的分布情况,可以用来观察 RNA 甲基化对TSS 等位点是否有偏好。


超微量RNA甲基化测序信息由上海云序生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于超微量RNA甲基化测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

超微量RNA甲基化测序 - 产品推荐
移动版: 资讯 直播 仪器谱

Copyright ©2007-2023 ANTPEDIA, All Rights Reserved

京ICP备07018254号 京公网安备1101085018 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号