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相对定量蛋白质组学(SWATH)

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       SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)是瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold 博士及其团队与AB SCIEX联合推出的一项全新的质谱技术。与传统的Shot-gun技术相比,SWATH采集模式能够将扫描区间内所有的肽段母离子经过超高速扫描并进行二级碎裂,从而获得完整的肽段信息。因而SWATH可以针对性研究感兴趣的蛋白质和肽段,数据具有全景式扫描,数据可回溯等优势。

技术流程


技术平台
       Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion™ Tribrid™

 

技术优势 

 

灵敏度高,它继承了MRM的数据采集模式,结合高分辨率的Triple-TOF5600 plus质谱系统,具有与MRM相当的灵敏度;

重复样品间的定量相关性可达到0.99以上; 

定量准确度几乎与MRM技术相当; 

定量范围可跨越4个数量级; 

定量的效果非常好。

 

应用领域 

 

机理和调控机制研究 

疾病标志物的筛选 

用药及预后标志物筛选 

疾病的分子分型


参考文献
Rapid mass spectrometric conversion of tissue biopsy samples into permanent quantitative digital proteome maps,Nature Medicine,2015,21:407?413 

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