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单核苷酸多态性分析(snp)检测服务

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基因单核苷酸多态性(SNP)突变检测服务

一、 定义:

1)一种遗传标记,包括单个碱基的缺失和插入,更多情况是单个碱基的置换。

2)通常情况下是一种二等位基因的变异,多为转换,即一种嘧***碱基换为另一种嘧***碱基,或一种 嘌呤碱基换为另一种嘌呤碱基,转换与颠换之比为2:1。

3)SNP在CG序列上出现zei为频繁,而且多是C→T,因为CG中C即胞嘧***常为甲基化的,自发脱氨 后即变为胸腺嘧***。

4)人类基因组SNP位点的数量:目前的估计不完全相同,有人估计每400bp就有一个碱基不同;另一 些人则估计变异频率在0.5‰--10‰。如果假定1/1000的碱基是多态,那么人类30亿碱基中就 有300万SNP位点。

5)SNP的分布不均匀,非转录序列中要多于转录序列,绝大多数位于蛋白的非编码区。

6)重要性:虽然SNP 不及RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)和短串联重复序列 STR标记变异程度高,但由于数量巨大,分布频密,因此就整体而言,其多态性要高得多。

7)检测方便:大多为二态,便于自动化批量检测。

二、 方法 DNA序列分析(DNA sequencing) 应用各种突变检测技术检测到的基因突变,zei后都需用序列分析才能确定突变类型及突变位置,其效率可以达到100%

主要有两种方法:

       1,测序法:现在的测序方法已与经典的方法有了很大的不同,其基本原理虽仍是双脱氧终止法,但自动化程度大为提高,操作更简便,测序时间也大大缩短。随着PCR技术与测序联合使用,不需经过M13亚克隆步骤,故称为直接测序法(direct sequencing,DS)。

       2,探针法:实验原理:探针只与模板特异性地结合,其结合位点在两条引物之间。探针的5′端标记有报告基团(Reporter, R),如FAM、VIC等,3′端标记有荧光淬灭基团(Quencher, Q),如TAMRA等。当探针完整的时候,报告基团所发射的荧光能量被淬灭基团吸收,仪器检测不到信号。随着PCR的进行,Taq酶在链延伸过程中遇到与模板结合的探针,其5′→3′外切核酸酶活性就会将探针切断,报告基团远离淬灭基团,其能量不能被吸收,即产生荧光信号。在探针的5’端使用不同的Report荧光基团,单一PCR中可以检测到多个探针的杂交与相应荧光。只有与模板完全匹配的TaqMan探针在与等位基因发生特异性杂交后,利用Taq酶的5’外切酶活性作用使得探针的5’Report荧光能够被检测。

实验步骤如下:

(1)客户收集标本(血液或组织等标本);

(2)确定基因突变SNP位点, 设计合成特异PCR扩增普通引物及探针,并在NCBI网站做BLAST;

(3)进行PCR扩增,通过SNP分型获得实验报告;

(4)分析报告,给出实验结果;

本公司提供探针法SNP技术服务.

单核苷酸多态性分析(snp)检测服务信息由上海拜力生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于单核苷酸多态性分析(snp)检测服务报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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