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DNA甲基化检测--重亚硫酸盐的测序法(Bisulfite Genomic Sequence,BSP)

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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

重亚硫酸盐的测序法实验流程(BSP)

原理:结合重亚硫酸盐的测序法是一种灵敏的能直接检测分析基因组DNA甲基化模式的方法。重亚硫酸盐处理后,用针对改变后的DNA序列设计特异性引物并进行聚合酶链式反应(PCR)。 PCR产物中原先非甲基化的胞嘧***位点被胸腺嘧***所替代,而甲基化的胞嘧***位点保持不变。PCR产物克隆后进行测序。通过这个方法能得到特定位点在各个基因组DNA分子中的甲基化状态。

特点:

1、特异性高,它能够提供特异性很高的分析结果,这是所有其他研究甲基化的分析方法所不能比拟的;

2、灵敏度高,可以用于分析少于100个细胞的检测样品。用微量的基因组DNA进行分析就能得到各个DNA分子精确的甲基化位点分布图。

            

                                                            重亚硫酸盐测序法技术实验流程

A. DNA制备

用DNA抽提试剂盒(Promega, cat. no. A1125)抽提组织,细胞培养物,石蜡包埋组织切片样品中的基因组DNA。

B.重亚硫酸盐处理

C. DNA纯化

用Wizard DNA clean?up kit (Promega, cat. no. A7280)纯化重亚硫酸盐处理后的DNA样品。

D. PCR扩增

E. PCR产物琼脂糖电泳后回收纯化

F. PCR产物连接到pMD19?T (Takara) 载体中克隆及测序。

G.用分析软件对各样本测序结果进行甲基化程度分析

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