Omni芯片家族自2009年上市以来，已经提供了一系列灵活的芯片，它们带来了精选自国际HapMap计划和千人基因组计划的常见和稀有变异。有了Omni芯片家族，研究人员能够立即开始新一代GWAS。 
Omni家族芯片产品信息

注：自定义位点是在芯片SNP位点基础上，可自定义添加最大位点数，N/A表示不能添加。 
 
1. Human Omni ZhongHua-8 BeadChip芯片服务（推荐）—特别覆盖中国人特有的常见和稀有变异
1）第一款人类种群特异的全基因组芯片，经过优化的标签SNP内容来自HapMap所有三个阶段以及千人基因组计划（1kGP），可用于在中国人种群中探索全新的疾病和性状关联。 
2）特别覆盖中国人81%的常见变异（MAF> 5%）和60%的稀有变异（MAF > 2.5%），适合全基因组关联研究（GWAS）。 
3）采用Illumina专利的BeadArrayTM技术，可提供非常高的数据质量，平均检出率> 99%，重复率> 99.9%。 

 
 
2.HumanOmni5-Quad芯片服务
1）4个样品的Omni5芯片特有超过430万个标记物/样品。 
2）特有来自千人基因组计划的新颖、常见和稀有变异。除了提供人类变异（MAF低至1%）的密集覆盖，覆盖了基因组中与疾病关联的高价值区域，包括基因区域、MHC区域和非同义SNP。 
3）特有来自千人基因组计划的近5000个插入缺失和多碱基替换标记物，能帮助研究人员阐明结构变异如何影响性状和疾病。 
4）可自定义的 500K位点让研究变得更具灵活性，可以方便更高密度靶定基因组的特定区域。 
  简单的实验过程：

 
 
更多的发现内容：
 

 
 您需要给我们提供： 
样品类型：组织、细胞、基因组DNA（> 3微克） 
样品要求： 
1) 样品纯度：OD 260/280值应在1.7～2.0 之间；RNA 应该去除干净；不得有其它个体或其它物种的DNA污染。 
2) 样品浓度：浓度不低于55ng/μl； 
3) 样品总量：每个样品总量不少于5μg 。 
4) 样品溶剂：溶解在TE中。 
5) 样品运输： DNA低温运输（-20℃）；在运输过程中请用parafilm将管口密封好，以防出现污染。 
 
 
我们能给您提供：

 
 
 
数据分析结果展示：
Manhattan plot:可以用来观测各个染色体中显著差异SNP探针的数据分布。基因组坐标沿X-轴显示，显示在Y-轴为每个单核苷酸多态性的关联P-值的负对数。

 
 
连锁不平衡（linkage disequilibrium）是指基因组中不同基因座间存在的非随机关联，即不同基因座的非等位基因间的非随机组合。LD Plot表示该基因所有snp的的连锁情况，各个方块的颜色由浅至深（白—红），表示连锁程度由低到高，深红色表示完全连锁。
 

 
 
LOD Plot (log odds score)是根据遗传标志与致病基因的连锁,和在家系中的重组值,即两者之间的遗传距离,得出两者连锁的似然性比例。LOD值为0，意味着连锁假设与不连锁假设的可能性相等；LOD值为正值，有利于连锁；LOD值为负值，表示有一定重组率的连锁。显著的域值是﹢3和﹢2。LOD﹦﹢3时，连锁的概率为95％。
 

 
 
单倍型又称单体型，是tagSNP的call在染色单体上的线性排列，单倍型分析的目的是看是否所有患病个体都继承了同样的单体型。在下图中，患病个体画框的里面单体型是一样的。

 

Illumina Omni家族芯片服务信息由上海英拜生物科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于Illumina Omni家族芯片服务报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途