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参考报价: | 7800 RMB(人民币) | 型号: | circRNA高通量测序实验 |
品牌: | 英拜生物 | 产地: | 上海 |
关注度: | 7 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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circRNA 是通过特殊的选择性剪切产生封闭环状结构的非编码RNA。 circRNA不受RNA外切酶的影响,比线性RNA表达更稳定。研究表明,某些特殊的 circRNA 分子富含 miRNA结合位点,在细胞中起到miRNA sponges的作用,进而解除 miRNA 对其靶基因的抑制作用。ciRS-7(CDR1a)包含 63 个保守的 miR-7结合位点,该 circRNA 在细胞中能够有效吸附miR-7。而miR-7 作为关键调节因子广泛参与癌症途径,如抑制在乳腺癌、胶质瘤等癌症中表达显著上调的Pak1的表达;miR-7 也能通过结合α-synuclein抑制其表达。这些研究暗示ciRS-7 通过ceRNA 机制调节miR-7的功能,是神经系统疾病和癌症治疗的潜在靶点。
图1 cirRNA转录过程 图2 ciRs-7作用机制
目前对circular RNA的研究还不多,特别是对这类RNA的生物学功能研究还有待挖掘。 通过高通量测序技术寻找反向剪接的reads,即back-splicing reads,可以检测样本中circRNA表达及其发现样本中新的circRNA。
图3 cirRNA测序实验流程
数据分析:
1、基础分析
测序数据评估及预处理
基因组比对
circRNA预测
circRNA注释
circRNA表达定量
circRNA差异表达分析
2、高级分析
circRNA关联基因的GO富集分析
circRNA关联基因的KEGG富集分析
circRNA-miRNA靶向预测
circRNA-miRNA-mRNA ceRNA分析
circRNA高通量测序实验信息由上海英拜生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于circRNA高通量测序实验报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途