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miRNA测序

参考报价: 面议 型号: miRNA测序
品牌: 基尔顿 产地: 上海
关注度: 22 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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一、服务介绍

microRNA(miRNA)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻译,从而在转录后水平调控蛋白表达(新发现miRNA也能在转录水平调控基因表达)。miRNA在物种进化中相当保守,在动物、植物和**等中发现的miRNA表达均有严格的组织特异性和时序性。miRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用,包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。

目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技术以及第二代测序技术。基于第二代测序技术的miRNA测序,可以一次获得数百万条miRNA序列,能够快速鉴定出不同组织、不同发育阶段、不同**状态下已知和未知的miRNA及其表达差异,为研究miRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具。


二、分析项目

标准分析项目

1) 原始数据质控(去接头污染,去低质量reads),数据产出统计;

2) 与参考序列比对;

3) 小RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、piRNA的比对信息;

4) 小RNA与miRBase 中指定范围的已知的 miRNA的比对;

5) 按照优先级将小RNA进行分类注释;

6) 预测新的miRNA;

7) 差异miRNA分析;

8) 差异miRNA表达聚类分析;

9) miRNA靶基因预测分析

10) 靶基因功能富集分析


上等分析项目(以下分析选择分析结果较好的3~5个)

靶基因蛋白互作网络分析

miRNA功能协同网络分析

miRNA通路协同网络分析

miRNA共调控网络分析

miRNA活性分析

按照客户要求对兴趣miRNA进行深入分析;

重要miRNA的功能富集分析;


三、样本要求

RNA样品总量: ≥3μg

RNA样品浓度: ≥200 ng/μL


四、项目周期

45个工作日



miRNA测序信息由基尔顿生物科技(上海)有限公司为您提供,如您想了解更多关于miRNA测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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